RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419445.5

PGGT1B-203, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PGGT1B, Length 9,545 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1B-203ENST00000419445 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 K7ESM1 405 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CELF2O95319 508 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EVI2BP34910 448 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPC1P35052 558 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OMPP47874 163 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CASP9P55211 416 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DSG2Q14126 1118 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SYPL1Q16563 259 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 XKR6Q5GH73 641 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 THOC7Q6I9Y2 204 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 REEP3Q6NUK4 255 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GDPD4Q6W3E5 623 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CCDC81Q6ZN84 652 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 DPPA4Q7L190 304 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM19Q96HH6 336 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL4I1Q96RQ9 567 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM43Q9BTV4 400 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 HCAR1Q9BXC0 346 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR51B5Q9H339 312 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBC1D14Q9P2M4 693 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SCML1Q9UN30 329 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPR55Q9Y2T6 319 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KCNE3Q9Y6H6 103 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C1orf105O95561 183 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CD37P11049 281 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SELPP16109 830 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CPEP16870 476 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ASMTP46597 345 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RPS25P62851 125 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OLR1P78380 273 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CEP78Q5JTW2 689 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TIGD3Q6B0B8 471 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF621Q6ZSS3 439 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PDZD3Q86UT5 571 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GTPBP2Q9BX10 602 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GON7Q9BXV9 100 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ENKD1Q9H0I2 346 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF556Q9HAH1 456 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RANGRFQ9HD47 186 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RHCGQ9UBD6 479 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 KLF15Q9UIH9 416 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CARD8Q9Y2G2 431 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EYSQ5T1H1 3165 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CENPVL1A0A0U1RR11 272 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OTOL1A6NHN0 477 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 M0QZ92 97 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 STK25O00506 426 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AKR7A2O43488 359 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AKAP8O43823 692 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBL1XO60907 577 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CKMP06732 381 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 IL3P08700 152 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GALP22466 123 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TBPL1P62380 186 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CNTN1Q12860 1018 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PIN1Q13526 163 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 NAE1Q13564 534 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MLC1Q15049 377 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZIC1Q15915 447 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GPAT3Q53EU6 434 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SPIN4Q56A73 249 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OAFQ86UD1 273 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SYT12Q8IV01 421 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 OR4Q3Q8NH05 313 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TM4SF18Q96CE8 201 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 AHCYL2Q96HN2 611 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF582Q96NG8 517 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 GFI1Q99684 422 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 RNF121Q9H920 327 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PAQR5Q9NXK6 330 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 SNX7Q9UNH6 387 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PIPSLA2A3N6 862 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 EPN2O95208 641 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C1QBP02746 253 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COX7A2P14406 83 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PTX3P26022 381 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAPK1P28482 360 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 COPZ1P61923 177 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 C2orf80Q0P641 193 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MAP4K2Q12851 820 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 VEPH1Q14D04 833 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 LRRC73Q5JTD7 316 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF684Q5T5D7 378 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 PAMR1Q6UXH9 720 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 Q6ZVU0 165 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TMEM25Q86YD3 366 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CLP1Q92989 425 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 FAM83DQ9H4H8 585 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CYSLTR2Q9NS75 346 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 TRPM5Q9NZQ8 1165 aa3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 CRNNQ9UBG3 495 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 ZNF780AO75290 641 aaPredicted RBP3.42□□□□□ -1.86
PGGT1B-203ENST00000419445 MPC2O95563 127 aa3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.2 ms