RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 HSPB3Q12988 150 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SLC14A1Q13336 389 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TP53BP2Q13625 1128 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 GK3PQ14409 553 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MYBPC3Q14896 1274 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TRIP10Q15642 601 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CRB2Q5IJ48 1285 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DDX59Q5T1V6 619 aaKnown RBP eCLIP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DBX2Q6ZNG2 339 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RNF130Q86XS8 419 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC116Q8IYX3 515 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LILRA2Q8N149 483 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SUN3Q8TAQ9 357 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF675Q8TD23 568 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 RASSF5Q8WWW0 418 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJC9Q8WXX5 260 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LRTOMTQ8WZ04 291 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LZICQ8WZA0 190 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CCDC74AQ96AQ1 378 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF578Q96N58 590 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 PELOQ9BRX2 385 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 C9orf16Q9BUW7 83 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 CHID1Q9BWS9 393 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 OSBPL10Q9BXB5 764 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 ASPSCR1Q9BZE9 553 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 USP22Q9UPT9 525 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 SNX8Q9Y5X2 465 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LOC400499M0QZD8 3231 aa9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 TP53BP1Q12888 1972 aaPredicted RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 MDC1Q14676 2089 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
POLR1A-202ENST00000409024 LY6G6EA0A0G2JKS1 128 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 H3BMH7 237 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CLOCKO15516 846 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CHST10O43529 356 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 FOXS1O43638 330 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KIF1CO43896 1103 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SH3BP5O60239 455 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PRAMEF10O60809 474 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CTNSO60931 367 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SERPINA1P01009 418 aa9.21□□□□□ -0.94
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POLR1A-202ENST00000409024 SLC35E2P0CK97 266 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ETFAP13804 333 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CPMP14384 443 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 EFNA1P20827 205 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MAGEA2P43356 314 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 GCGRP47871 477 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 KHKP50053 298 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ERFP50548 548 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CDK9P50750 372 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PCBP3P57721 371 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SELENOWP63302 87 aa9.21□□□□□ -0.94
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POLR1A-202ENST00000409024 CFHR1Q03591 330 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TRA2AQ13595 282 aaKnown RBP eCLIP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SCARB2Q14108 478 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PROX2Q3B8N5 592 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 NKAIN2Q5VXU1 208 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 REEP3Q6NUK4 255 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PPP4R4Q6NUP7 873 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CEACAM20Q6UY09 585 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PIWIL3Q7Z3Z3 882 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
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POLR1A-202ENST00000409024 GATAD2AQ86YP4 633 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 GPR135Q8IZ08 494 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LGI4Q8N135 537 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ICA1LQ8NDH6 482 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PMM1Q92871 262 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 ELP4Q96EB1 424 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SLC47A1Q96FL8 570 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SLC35G5Q96KT7 338 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DOHHQ9BU89 302 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LRRN3Q9H3W5 708 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 Q9H521 79 aa9.21□□□□□ -0.94
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POLR1A-202ENST00000409024 GIN1Q9NXP7 522 aa9.21□□□□□ -0.94
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POLR1A-202ENST00000409024 P2RX2Q9UBL9 471 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJB9Q9UBS3 223 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SRPK3Q9UPE1 567 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CLCA2Q9UQC9 943 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LIPT1Q9Y234 373 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MRPS2Q9Y399 296 aaKnown RBP9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 DTNAQ9Y4J8 743 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MAP4K5Q9Y4K4 846 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 MMACHCQ9Y4U1 282 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 PCDHGB3Q9Y5G1 929 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 U3KQA8 63 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 CROCCQ5TZA2 2017 aa9.21□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 LAMA1P25391 3075 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP9.2□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 GLOD5A6NK44 160 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 TTC36A6NLP5 189 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 C5orf58C9J3I9 102 aa9.2□□□□□ -0.94
POLR1A-202ENST00000409024 SUV39H1O43463 412 aa9.2□□□□□ -0.94
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