RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000390435.1

TRAV8-3-201, Transcript of T cell receptor alpha variable 8-3, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene TRAV8-3, Length 341 nt, Biotype TR V gene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAV8-3-201ENST00000390435 BBIP1A8MTZ0 92 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MYO1GB0I1T2 1018 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 FCHO1O14526 889 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 RFXANKO14593 260 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 NKX2-8O15522 239 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CPSF4O95639 269 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PGRP06401 933 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ABCB1P08183 1280 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SNRPB2P08579 225 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 LAMP1P11279 417 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 KRT20P35900 424 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CHI3L1P36222 383 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CASRP41180 1078 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MRPL19P49406 292 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PRIM2P49643 509 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 NRG3P56975 720 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 FOXL2P58012 376 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZNF155Q12901 538 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 STX5Q13190 355 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TP53BP2Q13625 1128 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MLC1Q15049 377 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PCOLCEQ15113 449 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 VPS26BQ4G0F5 336 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SPANXN4Q5MJ08 99 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 DCAF10Q5QP82 559 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C6orf10Q5SRN2 563 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 FAM69BQ5VUD6 431 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PLAG1Q6DJT9 500 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR4F3Q6IEY1 312 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CGB2Q6NT52 195 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 BORAQ6PGQ7 559 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PAOXQ6QHF9 649 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 KIRREL2Q6UWL6 708 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ANGPTL8Q6UXH0 198 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 HSDL2Q6YN16 418 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 RIMKLAQ8IXN7 391 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MMP21Q8N119 569 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PCYOX1LQ8NBM8 494 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR56A1Q8NGH5 318 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR1N1Q8NGS0 311 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 OR9A2Q8NGT5 310 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 DNAJB8Q8NHS0 232 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC2A12Q8TD20 617 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZNF675Q8TD23 568 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ADAMTS17Q8TE56 1095 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TSPEARQ8WU66 669 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 APOBEC4Q8WW27 367 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TM9SF4Q92544 642 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 NCLNQ969V3 563 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CIDECQ96AQ7 238 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PPWD1Q96BP3 646 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 COQ8BQ96D53 544 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CMTM5Q96DZ9 223 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 FBXL20Q96IG2 436 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 THOC3Q96J01 351 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAGED4Q96JG8 741 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 AMDHD1Q96NU7 426 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 LRRC37BQ96QE4 947 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PANX1Q96RD7 426 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SLC25A23Q9BV35 468 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 LHPPQ9H008 270 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ING2Q9H160 280 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 EPS8L2Q9H6S3 715 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MMP25Q9NPA2 562 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TAS2R9Q9NYW1 312 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PTGFRNQ9P2B2 879 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 LEF1Q9UJU2 399 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CES1P1Q9UKY3 287 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 VPS4AQ9UN37 437 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ERVK-19Q9WJR5 959 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 DOCK10Q96BY6 2186 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 NCOR2Q9Y618 2525 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 A0A087WV62 115 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TRBV11-1A0A0K0K1C0 115 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 A0A1W2PQ72 361 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMEM247A6NEH6 219 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TTC36A6NLP5 189 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CAPN14A8MX76 684 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MKRN2OSH3BPM6 223 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 EMC8O43402 210 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ZFAND5O76080 213 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SOX30O94993 753 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 KCNH1O95259 989 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 C6orf47O95873 294 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SERPINA7P05543 415 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 IFI6P09912 130 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 GPX3P22352 226 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ITPKBP27987 946 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 TMED10P49755 219 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PRKAG1P54619 331 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 PSPHP78330 225 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 MAP4K2Q12851 820 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CYLC2Q14093 348 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 RCAN2Q14206 197 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 CEBPEQ15744 281 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAV8-3-201ENST00000390435 ST3GAL2Q16842 350 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.4 ms