RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362832.1

RNU6-170P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 170, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-170P, Length 104 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMCO6Q96DC7 493 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BPIFA2Q96DR5 249 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF185Q96GF1 192 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C16orf58Q96GQ5 468 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 C9orf85Q96MD7 179 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSNARE1Q96NA8 513 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CCM2Q9BSQ5 444 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 POLR3GLQ9BT43 218 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MTIF3Q9H2K0 278 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DCLRE1BQ9H816 532 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GORASP2Q9H8Y8 452 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 XAB2Q9HCS7 855 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LUZP4Q9P127 313 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEC14L4Q9UDX3 406 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 DDX25Q9UHL0 483 aaKnown RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF230Q9UIE0 474 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RNF115Q9Y4L5 304 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KLK4Q9Y5K2 254 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLCO1B1Q9Y6L6 691 aa0□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PCM1Q15154 2024 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IGHV3-64DA0A0J9YX35 117 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 A0A1B0GVC2 190 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NKX2-6A6NCS4 301 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTGES3LE9PB15 166 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NPIPA3F8WFD2 350 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IMPA2O14732 288 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRAF2O60831 178 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSO75390 466 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CSDE1O75534 798 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SLITRK3O94933 977 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RCBTB2O95199 551 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SEMG1P04279 462 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MMP10P09238 476 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 WNT2P09544 360 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 P0C880 135 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 HNF1AP20823 631 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ACKR3P25106 362 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SRD5A2P31213 254 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OTX2P32243 289 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CRKLP46109 303 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RXRGP48443 463 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 NAGLUP54802 743 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBXN2AP68543 259 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ROR1Q01973 937 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BCL2L1Q07817 233 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CEACAM7Q14002 265 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BAATQ14032 418 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 KRT32Q14532 448 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 IL11RAQ14626 422 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PRSS8Q16651 343 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM174BQ3ZCQ3 159 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR2B11Q5JQS5 317 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LY6G6FQ5SQ64 297 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PLEKHS1Q5SXH7 462 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RAET1LQ5VY80 246 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 HAUS3Q68CZ6 603 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 BTNL8Q6UX41 500 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 APOOLQ6UXV4 268 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ADAMTSL5Q6ZMM2 481 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CENPVQ7Z7K6 275 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GCNT2Q8N0V5 402 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ALLCQ8N6M5 410 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GVQW1Q8N7I0 195 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSPAN14Q8NG11 270 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR51G1Q8NGK1 321 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OR52P1PQ8NH57 321 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 UBALD1Q8TB05 177 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 GRK7Q8WTQ7 553 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TEKT4Q8WW24 435 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 STARD8Q92502 1023 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TAF4BQ92750 862 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PTERQ96BW5 349 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF274Q96GC6 653 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 FAM210BQ96KR6 192 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SMIM14Q96QK8 99 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 PSMD1Q99460 953 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 LZTS2Q9BRK4 669 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TSSK1BQ9BXA7 367 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 HCAR1Q9BXC0 346 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OPN3Q9H1Y3 402 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SNX25Q9H3E2 840 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 APMAPQ9HDC9 416 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SIRT7Q9NRC8 400 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 OLAHQ9NV23 265 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 MARCH5Q9NX47 278 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RBAKQ9NYW8 714 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 AASSQ9UDR5 926 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RUVBL2Q9Y230 463 aaKnown RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 TMEM98Q9Y2Y6 226 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 COMMD10Q9Y6G5 202 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 CDH10Q9Y6N8 788 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 ZNF407Q9C0G0 2248 aa-0.01□□□□□ -2.41
RNU6-170P-201ENST00000362832 SHANK1Q9Y566 2161 aa-0.01□□□□□ -2.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.6 ms