RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000345512.7

PTPRU-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type U, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRU, Length 4,470 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ATAD3CQ5T2N8 411 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D3GQ6DHY5 549 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ALG1LQ6GMV1 187 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D3CQ6IPX1 549 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 LINGO2Q7L985 606 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NOXA1Q86UR1 476 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 AMIGO1Q86WK6 493 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 KLBQ86Z14 1044 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TBC1D3Q8IZP1 549 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 COX18Q8N8Q8 333 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ABCG5Q9H222 651 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NUDT14O95848 222 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 GAB1Q13480 694 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TMCO2Q7Z6W1 182 aaPredicted RBP14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 H0YIV9 168 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 C1SP09871 688 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SLC35G6P0C7Q6 338 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ACADMP11310 421 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SLC14A1Q13336 389 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 KLHDC8BQ8IXV7 354 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF683Q8IZ20 524 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 OR56A1Q8NGH5 318 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NDC1Q9BTX1 674 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 RNF186Q9NXI6 227 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 AP1M2Q9Y6Q5 423 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TSPAN9O75954 239 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SNAP47Q5SQN1 464 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 RTL4Q6ZR62 310 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 BBS10Q8TAM1 723 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 KCNK6Q9Y257 313 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NUMA1Q14980 2115 aa14.78□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 COL11A1P12107 1806 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SEMA3DO95025 777 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 NFATC1O95644 943 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 STOMP27105 288 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 MAT2AP31153 395 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 PFN3P60673 137 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 COL9A2Q14055 689 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 RAB33AQ14088 237 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 CNIH2Q6PI25 160 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 FRRS1Q6ZNA5 592 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 LILRB4Q8NHJ6 448 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 AKAP1Q92667 903 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 TTTY10Q9BZA0 68 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 COQ9O75208 318 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ACRP10323 421 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 SLC19A1P41440 591 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ARL4DP49703 201 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 MAP4K2Q12851 820 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 CCSMST1Q4G0I0 132 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ARMCX6Q7L4S7 300 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ELMOD2Q8IZ81 293 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF655Q8N720 491 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 OR52E4Q8NGH9 312 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 PUM2Q8TB72 1066 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 CD180Q99467 661 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 BRD7Q9NPI1 651 aa14.77□□□□□ -0.04
PTPRU-201ENST00000345512 C2orf92A0A1B0GVN3 265 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ARAFP10398 606 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HLA-FP30511 346 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PTGER1P34995 402 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 KHDRBS2Q5VWX1 349 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LIN28BQ6ZN17 250 aaKnown RBP eCLIP14.77□□□□□ -0.054e-8■■■■■ 34.6
PTPRU-201ENST00000345512 FAM124AQ86V42 546 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 LILRA3Q8N6C8 439 aaPredicted RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR5D16Q8NGK9 328 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR14C36Q8NHC7 312 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 RFT1Q96AA3 541 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TM9SF2Q99805 663 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZSCAN32Q9NX65 697 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IKZF2Q9UKS7 526 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 WDR45Q9Y484 360 aa14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZFC3H1O60293 1989 aaKnown RBP14.77□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MID1O15344 667 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 EEF1E1O43324 174 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR6A2O95222 327 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IFNA16P05015 189 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 IMPA1P29218 277 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 CSNK1DP48730 415 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 BTN3A2P78410 334 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 BIKQ13323 160 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 ZNF852Q6ZMS4 543 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 PROKR2Q8NFJ6 384 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 WFIKKN2Q8TEU8 576 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SETD7Q8WTS6 366 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 JPH3Q8WXH2 748 aaPredicted RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 WDR26Q9H7D7 661 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 A3GALT2U3KPV4 340 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 HMX3A6NHT5 357 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 MRPL3P09001 348 aaKnown RBP14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 F8A1P23610 371 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 TOR1AIP1Q5JTV8 583 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR2G6Q5TZ20 316 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GDPD3Q7L5L3 318 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 SYNPOQ8N3V7 929 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 OR6K6Q8NGW6 343 aa14.76□□□□□ -0.05
PTPRU-201ENST00000345512 GRHL3Q8TE85 626 aa14.76□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.7 ms