RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000326294.3

PTPRCAP-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type C associated protein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRCAP, Length 1,292 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRCAP-201ENST00000326294 GPR137Q96N19 417 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 SMC6Q96SB8 1091 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 MECRQ9BV79 373 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 EBPLQ9BY08 206 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 WWTR1Q9GZV5 400 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEPPQ9NTK1 212 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 DLGAP4Q9Y2H0 992 aa18.09■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 CROCCQ5TZA2 2017 aa18.08■□□□□ 0.49
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A0G2JMM0 328 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PPB8 328 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GNG14A0A1W2PPG7 69 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 A0A1W2PRS3 328 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLGA6L10A6NI86 522 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 KIR3DP1A8MWS1 328 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ERAL1O75616 437 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ATP1B1P05026 303 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 UROSP10746 265 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGER1P34995 402 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DEKP35659 375 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FEN1P39748 380 aaKnown RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ALDH9A1P49189 494 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BTKQ06187 659 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C4orf17Q53FE4 359 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OPN5Q6U736 354 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RTL4Q6ZR62 310 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC29A4Q7RTT9 530 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF441Q8N8Z8 693 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 POGLUT1Q8NBL1 392 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC22A8Q8TCC7 542 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf78Q8WTQ4 265 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CNRIP1Q96F85 164 aaPredicted RBP18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF681Q96N22 645 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TRMOQ9BU70 441 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.08■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PINLYPA6NC86 204 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 WIPF3A6NGB9 483 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 KLRC4-KLRK1H3BQV0 150 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRTM2O43300 516 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TYROBPO43914 113 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RSL1D1O76021 490 aaKnown RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CSNK2A2P19784 350 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RFC3P40938 356 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MGAT2Q10469 447 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 IMPG1Q17R60 797 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRICKLE4Q2TBC4 344 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPDYAQ5MJ70 313 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C1QL3Q5VWW1 255 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM180BQ6P0A1 224 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF615Q8N8J6 731 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZFP62Q8NB50 900 aaPredicted RBP18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GOLM1Q8NBJ4 401 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 MAT2BQ9NZL9 334 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 UTS2RQ9UKP6 389 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL27Q9Y4X3 112 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PTGDR2Q9Y5Y4 395 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 EXPH5Q8NEV8 1989 aa18.07■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 AZIN1O14977 448 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CHRNGP07510 517 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ANXA4P09525 319 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DRD2P14416 443 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 S1PR1P21453 382 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SOX18P35713 384 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF791Q3KP31 576 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 KRTCAP3Q53RY4 240 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C6orf163Q5TEZ5 329 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 KANK2Q63ZY3 851 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FAM111BQ6SJ93 734 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 LRRC25Q8N386 305 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 VWA5B2Q8N398 1253 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SLC15A4Q8N697 577 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SPACA9Q96E40 222 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SGCZQ96LD1 299 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR10A5Q9H207 317 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SENP1Q9P0U3 644 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PSME2Q9UL46 239 aa18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 POLR3HQ9Y535 204 aaPredicted RBP18.06■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 G3V3Y1 287 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 NPHS1O60500 1241 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBBP07437 444 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 CCL3P10147 92 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 PRPH2P23942 346 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ETV4P43268 484 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 GSTM5P46439 218 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF763Q0D2J5 394 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DUSP8Q13202 625 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 LTB4RQ15722 352 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 RNF165Q6ZSG1 346 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZCCHC23Q6ZST2 131 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR2M7Q8NG81 312 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 OR7G1Q8NGA0 311 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 C16orf52Q8NHV5 167 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 BRINP2Q9C0B6 783 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 TUBB1Q9H4B7 451 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 SH2D2AQ9NP31 389 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 ZNF639Q9UID6 485 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 DTX4Q9Y2E6 619 aa18.05■□□□□ 0.48
PTPRCAP-201ENST00000326294 FIS1Q9Y3D6 152 aa18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 50.7 ms