RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000323374.8

SPHK1-201, Transcript of sphingosine kinase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPHK1, Length 2,138 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPHK1-201ENST00000323374 COPS4Q9BT78 406 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 IMPAD1Q9NX62 359 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa20.52■□□□□ 0.88
SPHK1-201ENST00000323374 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 A6NCN8 305 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FOXD2O60548 495 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 HMGN2P05204 90 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 C8orf89P0DMQ9 161 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ALPPL2P10696 532 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 NR4A1P22736 598 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MPIP34949 423 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP2Q05923 314 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 AQP6Q13520 282 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 LASP1Q14847 261 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CTF1Q16619 201 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 PRRT3Q5FWE3 981 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 KLHL17Q6TDP4 642 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CROCCP3Q8IVE0 287 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CCDC103Q8IW40 242 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MYDGFQ969H8 173 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SPATA5L1Q9BVQ7 753 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 BCL2L10Q9HD36 194 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF226Q9NYT6 803 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CD207Q9UJ71 328 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 GABARAPO95166 117 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZBTB11O95625 1053 aaPredicted RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 PTGER1P34995 402 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CDC42P60953 191 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 PRR5P85299 388 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SPCS2Q15005 226 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 PTGES3Q15185 160 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DCST1Q5T197 706 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 TMEM107Q6UX40 140 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DNAJC22Q8N4W6 341 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 KCT2Q8NC54 265 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 NT5CQ8TCD5 201 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 YIPF6Q96EC8 236 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DHRS1Q96LJ7 313 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FCRL4Q96PJ5 515 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 KCNK12Q9HB15 430 aa20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 TRNAU1APQ9NX07 287 aaKnown RBP20.51■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CLCA1A8K7I4 914 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SEMA7AO75326 666 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 OXSR1O95747 527 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ADAP00813 363 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 H1F0P07305 194 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 GABRB1P18505 474 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CTSKP43235 329 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SMIM11AP58511 58 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CEBPEQ15744 281 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ALG11Q2TAA5 492 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 C11orf91Q3C1V1 193 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FAM92BQ6ZTR7 304 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 NRROSQ86YC3 692 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 RBM45Q8IUH3 476 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 YIPF4Q9BSR8 244 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ACAD8Q9UKU7 415 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DUSP12Q9UNI6 340 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF780BQ9Y6R6 833 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 OR2A25A4D2G3 310 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FAAHO00519 579 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 EMC8O43402 210 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SLC35G6P0C7Q6 338 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 GABRG2P18507 467 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ELAVL4P26378 380 aaKnown RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CRISP1P54107 249 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 DGCR6Q14129 220 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO42Q6P3S6 717 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 OR4D11Q8NGI4 311 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FLVCR1-AS1Q8TAF5 88 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MIPOL1Q8TD10 442 aa20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 OTUB1Q96FW1 271 aaPredicted RBP20.5■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SNRNP200O75643 2136 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FAM227AF5H4B4 570 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZNF888P0CJ79 500 aaPredicted RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 NR2F6P10588 404 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MAGP20916 626 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CHMP24386 653 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 TFF2Q03403 129 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MOGQ16653 247 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FBXO43Q4G163 708 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 UBE2UQ5VVX9 321 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FRMPD2BQ6IN97 320 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 TRIM73Q86UV7 250 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 P2RY8Q86VZ1 359 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FCGR1BQ92637 280 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 GGHQ92820 318 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 OR2A14Q96R47 310 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 C3orf14Q9HBI5 128 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FKBP14Q9NWM8 211 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 FTSJ1Q9UET6 329 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MMP17Q9ULZ9 603 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 MGAT4BQ9UQ53 548 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 HS3ST3A1Q9Y663 406 aa20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP20.49■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 COL4A2P08572 1712 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ZAR1LA6NP61 321 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 CHRM4P08173 479 aa20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 ILF3Q12906 894 aaKnown RBP eCLIP20.48■□□□□ 0.87
SPHK1-201ENST00000323374 Q6ZSR6 202 aa20.48■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.9 ms