RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261169.10

LMO3-201, Transcript of LIM domain only 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene LMO3, Length 3,810 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO3-201ENST00000261169 KLRF1Q9NZS2 232 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 USP36Q9P275 1121 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 DNMT3BQ9UBC3 853 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 APOBEC3BQ9UH17 382 aaKnown RBP5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ABCG2Q9UNQ0 655 aa5.26□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 BTAF1O14981 1849 aa5.26□□□□□ -1.57
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LMO3-201ENST00000261169 CDC40O60508 579 aaKnown RBP eCLIP5.25□□□□□ -1.57
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LMO3-201ENST00000261169 POU6F2P78424 691 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
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LMO3-201ENST00000261169 CDK5R2Q13319 367 aa5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 LSAMPQ13449 338 aa5.25□□□□□ -1.57
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LMO3-201ENST00000261169 WDR20Q8TBZ3 569 aa5.25□□□□□ -1.57
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LMO3-201ENST00000261169 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 TTYH1Q9H313 450 aaPredicted RBP5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 ARMC1Q9NVT9 282 aa5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MYEF2Q9P2K5 600 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 RIMS3Q9UJD0 308 aa5.25□□□□□ -1.57
LMO3-201ENST00000261169 MGAT4BQ9UQ53 548 aa5.25□□□□□ -1.57
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