RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000088356.9

Usf3-201, Transcript of Gene model 608, (NCBI), mousemouse

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene Usf3, Length 757 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usf3-201ENSMUST00000088356 H2afyQ9QZQ8 372 aaKnown RBP15.98■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr1066A2AK62 313 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm498D3YYH9 372 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zfp870J3QMA4 560 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm8926L7MUE8 181 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Efna3O08545 230 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Stmn3O70166 180 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 CgaP01216 120 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mmp2P33434 662 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pax7P47239 503 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Rad23aP54726 363 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pafah1b1P63005 410 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 UcmaQ14BU0 138 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tbc1d24Q3UUG6 561 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 TsnQ62348 228 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 GcsamQ6RFH4 181 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nadsyn1Q711T7 725 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Klhdc1Q80YG3 406 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Chmp2bQ8BJF9 213 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dnali1Q8BVN8 258 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Trnt1Q8K1J6 434 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Eif3lQ8QZY1 564 aaKnown RBP15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr1311Q8VET0 312 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Sfxn2Q925N2 322 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Asb12Q9D738 308 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pin1Q9QUR7 165 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 MeltfQ9R0R1 738 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Net1Q9Z206 595 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Hivep1Q03172 2688 aa15.97■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm3409A0A0G2JE67 319 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr1337A2ACY8 315 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 B1ARW8 110 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kbtbd6E9PYD7 486 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 1600015I10RikE9Q745 711 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Vmn2r35E9Q7U8 861 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Kbtbd7G5E8C2 690 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm6408J3QNG1 320 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm3402K7N5P2 326 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Eftud2O08810 971 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nfatc2ipO09130 412 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 LtfP08071 707 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Prim2P33610 505 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Elk1P41969 429 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 LipnQ3U4B4 400 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Nsg1Q62092 185 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Epha6Q62413 1035 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 BocQ6AZB0 1110 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tas2r40Q7TQB8 319 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ckap2lQ7TS74 745 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zswim5Q80TC6 1188 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mup21Q80YX8 181 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mrps35Q8BJZ4 320 aaKnown RBP15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam69cQ8BQT2 410 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Prps1l1Q8C5R8 318 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Uap1Q91YN5 522 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cdrt4Q9DA64 179 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Adam28Q9JLN6 793 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dok3Q9QZK7 444 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Aldh18a1Q9Z110 795 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Krt6bQ9Z331 562 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dock9Q8BIK4 2055 aa15.96■□□□□ 0.15
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tet1Q3URK3 2007 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm11565A2A4M7 156 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm21981D3Z6Q6 369 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr726E9Q8X3 321 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Fam71e2L7N480 754 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Mtx2O88441 263 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Wnt3P17553 355 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Elk3P41971 409 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Serpinb5P70124 375 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr725Q05A45 321 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Bcl2l15Q08ED0 167 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Pou4f2Q63934 411 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Cfap206Q6PE87 622 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 GanabQ8BHN3 944 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ces2eQ8BK48 559 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Naa25Q8BWZ3 972 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc63Q8CDV6 558 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 CrhQ8CIT0 187 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Olfr1393Q8VFA7 311 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Asb8Q91ZT9 288 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 ToporslQ9D2F8 683 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Iqcf1Q9D9K8 182 aa15.95■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Svep1A2AVA0 3567 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ankfn1A0A140LIW7 1083 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm8444F6XS56 118 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ces2hF6Z9B9 558 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Vmn2r28L7N203 852 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Gm3187M0QWW3 260 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Abcd4O89016 606 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 P01680 129 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ier2P17950 221 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 RykQ01887 594 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tgtp2Q3T9E4 415 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Dnajc11Q5U458 559 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Prkg2Q61410 762 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tgtp1Q62293 415 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Tspyl5Q69ZB3 406 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Ccdc116Q80X53 541 aa15.94■□□□□ 0.14
Usf3-201ENSMUST00000088356 Zfp398Q8BV16 643 aa15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 40.3 ms