RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000040182.12

Ccdc88a-201, Transcript of Girdin, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ccdc88a, Length 9,376 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Slc6a11P31650 627 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Kiaa0895lQ810A5 467 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Slc27a4Q91VE0 643 aaKnown RBP15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Slamf1Q9QUM4 343 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Nrxn3Q6P9K9 1571 aa15.95■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 KitlgP20826 273 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Mpp7Q8BVD5 576 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr643Q8VGY1 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 PnckQ9QYK9 343 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm42688A0A0R3P9D1 673 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Zfp982A2A8Q4 368 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Zfp871G5E905 615 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Pmm1O35621 262 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Tmco2P0C1V4 183 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Il2rbP16297 539 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Sult4a1P63046 284 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 DglucyQ8BH86 617 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Rnf26Q8BUH7 424 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 CipcQ8R0W1 432 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Slco6d1Q9D5W6 683 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Clca3a2Q9EQR4 902 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Clca3a1Q9QX15 902 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 HnrnpfQ9Z2X1 415 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Sipa1l2Q80TE4 1722 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Cyp27b1O35084 507 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Dok2O70469 412 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Csn1s2bP02664 143 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Fbxo7Q3U7U3 523 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr1364Q5SZS9 314 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Irak2Q8CFA1 622 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Rab11bP46638 218 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Parp8Q3UD82 852 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Q3UTZ3 580 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Pcp4l1Q6W8Q3 68 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Znf410Q8BKX7 478 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Sphk1Q8CI15 382 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Arhgap8Q9CXP4 425 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Trmt10bQ9D075 318 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Eif4e3Q9DBB5 207 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Lat2Q9JHL0 203 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Ankdd1aA0A1L1ST07 508 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Wdr76A6PWY4 622 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 ThP24529 498 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 CcnjQ3TZI6 379 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 EtfdhQ921G7 616 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 NplQ9DCJ9 320 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm3676D3Z236 184 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm3573L7N292 184 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 SirpaP97797 513 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Pou6f2Q8BJI4 691 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 CptpQ8BS40 216 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Rnf170Q8CBG9 286 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 SgtbQ8VD33 304 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 1700001F09RikQ9DAR5 184 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 March8Q9DBD2 286 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Acp4D3YTS9 425 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Adh6aE9Q5Z6 375 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm4847G3X946 537 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Glb1l2Q3UPY5 636 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 BC061237Q6P8I2 184 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Il1rl2Q9ERS7 574 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Ate1Q9Z2A5 516 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Med1Q925J9 1575 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 FgaE9PV24 789 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Fmo5P97872 533 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Bod1Q5SQY2 173 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 MuskQ61006 868 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Rsl1Q7M6Y1 485 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gpr176Q80WT4 515 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Lrrtm2Q8BGA3 515 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Nudt7Q99P30 236 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Il20Q9JKV9 176 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Spint1Q9R097 507 aa15.94■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 SgcbP82349 320 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 LsampQ8BLK3 341 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm5662Q8BX20 144 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Vmn1r49Q9WUF1 310 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Kcns2O35174 477 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Anxa11P97384 503 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Defb23Q30KP0 166 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Cyp2d26Q8CIM7 500 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Vmn1r229Q8R2A9 306 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr382Q8VF79 312 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr771Q8VFH6 317 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr1100Q8VFM1 321 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Cyp11a1Q9QZ82 526 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Ino80eA0A0U1RP99 260 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Olfr640E9Q7P5 314 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 PvrQ8K094 408 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gsto2Q8K2Q2 248 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Mettl22Q8R1C6 393 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Ak5Q920P5 562 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Q9CZV2 255 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Tmem200cJ3QK46 637 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm3633L7N233 213 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Gm9611L7N476 213 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Slc35g3Q5F297 340 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 TefmQ5SSK3 364 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Rxfp4Q7TQP4 414 aa15.93■□□□□ 0.14
Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 Prr5Q812A5 387 aa15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38 ms