RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000008088.8

Ttc9b-201, Transcript of Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ttc9b, Length 2,052 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Palm2Q8BR92 376 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Guca1bQ8VBV8 201 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1390Q8VGW9 311 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CenpnQ9CZW2 337 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Capns2Q9D7J7 247 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl8a6Q9DAY2 240 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Rai1Q61818 1889 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn2r18E9Q280 788 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc27a6E9Q9W4 619 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Vmn1r25H3BLP0 302 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrrc23O35125 340 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 ChadO55226 358 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 DdcO88533 480 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dlx5P70396 289 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cct3P80318 545 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gdpgp1Q3TLS3 386 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Tmem64Q3U145 381 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Aldh16a1Q571I9 802 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnh1Q60603 989 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Naa50Q6PGB6 169 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr591Q7TRR7 314 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ap4e1Q80V94 1122 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pik3cbQ8BTI9 1064 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fbxl22Q8C7B6 236 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lrp11Q8CB67 483 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zfpm2Q8CCH7 1151 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 HopxQ8R1H0 73 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Zc3h10Q8R205 435 aaKnown RBP18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Asb8Q91ZT9 288 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D10Jhu81eQ9D172 266 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fabp12Q9DAK4 132 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Natd1Q9DBW3 110 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CalyQ9DCA7 226 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Srpk3Q9Z0G2 565 aa18.73■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm37596A0A0A6YXL2 336 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Xlr5aA2BI45 236 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm17615E9Q9P2 165 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Opn1mwO35599 359 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc6a2O55192 617 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mup4P11590 178 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BrafP28028 804 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ica1P97411 478 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D17Wsu92eQ3TT38 291 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Dhrs11Q3U0B3 260 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ankrd42Q3V096 527 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akt2Q60823 481 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ddx5Q61656 614 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 D11Wsu47eQ6PIX9 558 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kmt5cQ6Q783 468 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cd3eapQ76KJ5 399 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr1015Q7TR94 312 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mfn1Q811U4 741 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PpcdcQ8BZB2 204 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 CcinQ8CDE2 588 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Olfr700Q8VFM5 316 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Scpep1Q920A5 452 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nmd3Q99L48 503 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Trpd52l3Q9CQ14 231 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ncbp2Q9CQ49 156 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Susd3Q9D176 269 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mid2Q9QUS6 705 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mapk11Q9WUI1 364 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cldn6Q9Z262 219 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fer1l5P0DM40 2038 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Smurf2A2A5Z6 748 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam83cA2ARK0 776 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Kcnmb3E9Q7U0 239 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 P01629 112 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 H2-D1P14427 368 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 F9P16294 471 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 PlgP20918 812 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SynaQ5G5D5 617 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q5SPV6 233 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Defa-rs10Q64263 91 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Nrde2Q80XC6 1172 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8BH50 245 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 SinhcafQ8C8M1 221 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Thap1Q8CHW1 210 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Q8R3C1 574 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdhr5Q8VHF2 831 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Sp7Q8VI67 428 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Akr1c21Q91WR5 323 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam118aQ91YN1 357 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 BniplQ99JU7 328 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Eral1Q9CZU4 437 aaKnown RBP18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Pex13Q9D0K1 405 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl8a8Q9DAS4 241 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prl8a1Q9DAV8 240 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Lypd2Q9DD23 127 aa18.72■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Alms1Q8K4E0 3251 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Igkv15-103A0A140T8P3 115 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Gm595A2AF73 655 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Cdh2P15116 906 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prkg2Q61410 762 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ostf1Q62422 215 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Mospd3Q8BGG6 235 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Fam69cQ8BQT2 410 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Ndrg4Q8BTG7 352 aaKnown RBP18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Slc5a8Q8BYF6 611 aa18.71■□□□□ 0.59
Ttc9b-201ENSMUST00000008088 Prokr2Q8K458 381 aa18.71■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 69.5 ms