RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000004097.15

Cux1-201, Transcript of Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene Cux1, Length 12,862 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vmn1r40Q9EQ46 310 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 B3galt5Q9JI67 308 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mbd1Q9Z2E2 636 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Atxn7l3A2AWT3 347 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Wnt3aP27467 352 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Jagn1Q5XKN4 183 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Prl3a1Q78Y73 227 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr352Q8VGJ9 315 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 EtfdhQ921G7 616 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gje1Q9CX92 205 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fezf2Q9ESP5 455 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Padi4Q9Z183 666 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Numa1E9Q7G0 2094 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1095A3KPP7 308 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 LcatP16301 438 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Doc2bP70169 412 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mtcp1Q60945 107 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Znf750Q8BH05 703 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Bmt2Q8BXK4 403 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Grhl1Q921D9 618 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Acy1Q99JW2 408 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Lancl2Q9JJK2 450 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cntn6Q9JMB8 1028 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 DstnQ9R0P5 165 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nprl2Q9WUE4 380 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 GzmgP13366 248 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Il13P20109 131 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fbxw11Q5SRY7 542 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mindy1Q76LS9 468 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tas2r136Q7TQA8 305 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rap2cQ8BU31 183 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr736Q8VFT6 312 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fastkd2Q922E6 689 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vps29Q9QZ88 182 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr31E9Q3K2 317 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Btbd35f22J3QN64 498 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hsd17b10O08756 261 aaKnown RBP7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pdha2P35487 391 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 DckP43346 260 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Npy2rP97295 381 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 StradaQ3UUJ4 431 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1211Q7TR09 311 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Hsd17b13Q8VCR2 304 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dnajc24Q91ZF0 196 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 PolmQ9JIW4 496 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Mageh1Q9NWG9 218 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dip2cE9PWR4 1557 aa7.89□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1150-ps1A0A1L1STL1 316 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rex2A2AWF2 685 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Sertad4A7DTG3 377 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dlx2P40764 332 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Inpp5jP59644 1003 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rars2Q3U186 578 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 BC100530Q497J0 97 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 D630039A03RikQ8K0M7 236 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dph3Q8K0W9 82 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr1141Q8VFQ7 311 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 HemgnQ9ERZ0 503 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Dmrta2A2A9A2 531 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm13102A2ASJ3 519 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cldn34b1B1AZQ8 209 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Chst13D3Z6E3 336 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Gm26965M0QWH4 86 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Fgf1P61148 155 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Smim15Q3UTD9 74 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cd300aQ6SJQ0 318 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Tab1Q8CF89 502 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp87Q8K2A4 540 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Alkbh6Q8K2U2 238 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Pcdhb8Q91XZ2 779 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 AspnQ99MQ4 373 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 NenfQ9CQ45 171 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Nudt21Q9CQF3 227 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cldn34b2Q9D9N2 209 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 MecrQ9DCS3 373 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Spp1P10923 294 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Stat5aP42230 793 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Commd6Q3V4B5 87 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 TefmQ5SSK3 364 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Garem2Q6PAJ3 880 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ccdc126Q8BIS8 140 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 FgbQ8K0E8 481 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Rab27bQ99P58 218 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Apbb2Q9DBR4 760 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ces2gE9PV38 560 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 5830473C10RikF8VQ07 620 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Olfr417F8VQB1 309 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Vmn2r92L7N2A4 860 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Scarb2O35114 478 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Zfp13P10754 512 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Kcnc1P15388 511 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 PrkcaP20444 672 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Adgrg2Q8CJ12 1009 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Cyp4f15Q99N18 534 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Ttc9bQ9D6E4 239 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Orc6Q9WUJ8 262 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Urb1Q571H0 2274 aaKnown RBP7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Btbd2E9PUS2 523 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 RorcP51450 516 aa7.88□□□□□ -1.15
Cux1-201ENSMUST00000004097 Slc22a23Q3UHH2 689 aa7.88□□□□□ -1.15
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 21.4 ms