RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000635843.1

EFHC1-208, Transcript of EF-hand domain containing 1, human

TSL 4

Gene EFHC1, Length 452 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
EFHC1-208	ENST00000635843	CHD4	Q14839	1912 aa		13.87	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	CNBD1	Q8NA66	436 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	GOLGB1	Q14789	3259 aa	Known RBP	13.86	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		13.86	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	PDE6B	P35913	854 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	GNAI1	P63096	354 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	MBIP	Q9NS73	344 aa		13.85	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	KDM3B	Q7LBC6	1761 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	GPT	P24298	496 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	ST5	P78524	1137 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	PROSER3	Q2NL68	480 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	COPS6	Q7L5N1	327 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.84	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.83	□□□□□ -0.19
EFHC1-208	ENST00000635843	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.83	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	PDIA6	Q15084	440 aa		13.83	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		13.83	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	TTLL6	Q8N841	843 aa		13.83	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		13.83	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF853	P0CG23	659 aa		13.82	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	13.82	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.82	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	IFT57	Q9NWB7	429 aa		13.82	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	ERBB4	Q15303	1308 aa		13.82	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	UTRN	P46939	3433 aa		13.81	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	WWC1	Q8IX03	1113 aa		13.81	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.81	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		13.81	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	13.8	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.8	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		13.8	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		13.8	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	RGL2	O15211	777 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	NYX	Q9GZU5	481 aa		13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	C21orf2	O43822	256 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	CNKSR1	Q969H4	720 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	HYPK	Q9NX55	129 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.78	□□□□□ -0.2
EFHC1-208	ENST00000635843	TCERG1	O14776	1098 aa	Known RBP	13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	HOXB7	P09629	217 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	SRGN	P10124	158 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	NUP98	P52948	1817 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	MASTL	Q96GX5	879 aa		13.77	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	NPR1	P16066	1061 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	TCIRG1	Q13488	830 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	STYK1	Q6J9G0	422 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	TSPYL6	Q8N831	410 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		13.76	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	PARP10	Q53GL7	1025 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	GPBP1L1	Q9HC44	474 aa	Predicted RBP	13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	RNF181	Q9P0P0	153 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13.75	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	RASSF7	Q02833	373 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	RPGR	Q92834	1020 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	TRMT112	Q9UI30	125 aa	Known RBP	13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		13.74	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ALDH1B1	P30837	517 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	SYNE4	Q8N205	404 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	NLRP3	Q96P20	1036 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	STK31	Q9BXU1	1019 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	BRCA1	P38398	1863 aa	Known RBP	13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	ATP10D	Q9P241	1426 aa		13.73	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	IL16	Q14005	1332 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13.72	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.72	□□□□□ -0.21
EFHC1-208	ENST00000635843	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	13.72	□□□□□ -0.21

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