RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000619193.4

RDM1-223, Transcript of RAD52 motif containing 1, human

TSL 1 (best)

Gene RDM1, Length 686 nt, Biotype nonsense mediated decay.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RDM1-223	ENST00000619193	TRIM37	O94972	964 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	BRD1	O95696	1058 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	PTGER2	P43116	358 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	CCT4	P50991	539 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	NUCB2	P80303	420 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ATP8B2	P98198	1209 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	VPS72	Q15906	364 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ESYT1	Q9BSJ8	1104 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	SYT17	Q9BSW7	474 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	RBSN	Q9H1K0	784 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	MIS18A	Q9NYP9	233 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	THSD7A	Q9UPZ6	1657 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	NWD2	Q9ULI1	1742 aa		7.3	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	AOX1	Q06278	1338 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ERC2	O15083	957 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	EIF5B	O60841	1220 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ZBTB7A	O95365	584 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	CHML	P26374	656 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ZSCAN23	Q3MJ62	389 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF579	Q8NAF0	562 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	IL17RE	Q8NFR9	667 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	UBE2Q2	Q8WVN8	375 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ARX	Q96QS3	562 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	CWC22	Q9HCG8	908 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	RBM27	Q9P2N5	1060 aa	Known RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	CEMIP	Q8WUJ3	1361 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	RPAP1	Q9BWH6	1393 aa	Predicted RBP	7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	ABCA3	Q99758	1704 aa		7.29	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	SOS1	Q07889	1333 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	USP42	Q9H9J4	1324 aa	Known RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	HAP1	P54257	671 aa	Predicted RBP	7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	CCDC173	Q0VFZ6	552 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	SSH3	Q8TE77	659 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	TMX3	Q96JJ7	454 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	USP44	Q9H0E7	712 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM63C	Q9P1W3	806 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	LTN1	O94822	1766 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	RGPD2	P0DJD1	1756 aa		7.28	□□□□□ -1.24
RDM1-223	ENST00000619193	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	APBA3	O96018	575 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	GNAI2	P04899	355 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ANAPC15	P60006	121 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	FLII	Q13045	1269 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TSHZ3	Q63HK5	1081 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	MCTP1	Q6DN14	999 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	RASEF	Q8IZ41	740 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	PI4K2B	Q8TCG2	481 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TTC14	Q96N46	770 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TSPYL4	Q9UJ04	414 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	EXOC6B	Q9Y2D4	811 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	MAP3K5	Q99683	1374 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		7.27	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HMMR	O75330	724 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	OFD1	O75665	1012 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	REC8	O95072	547 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HOXC9	P31274	260 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	NUBP1	P53384	320 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HS1BP3	Q53T59	392 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TMEM87A	Q8NBN3	555 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	KCNB2	Q92953	911 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	INTS4	Q96HW7	963 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	DDX49	Q9Y6V7	483 aa	Known RBP	7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	SLIT3	O75094	1523 aa		7.26	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	MRC1	P22897	1456 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ZNF500	O60304	480 aa	Predicted RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	MX1	P20591	662 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HSPA4	P34932	840 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	HDGF	P51858	240 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ST3GAL1	Q11201	340 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	CAVIN1	Q6NZI2	390 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	LRSAM1	Q6UWE0	723 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ZSCAN30	Q86W11	494 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	DNAJC5G	Q8N7S2	189 aa		7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	LSG1	Q9H089	658 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	LRRFIP2	Q9Y608	721 aa	Known RBP	7.25	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ADCY9	O60503	1353 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	ST18	O60284	1047 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	GABBR2	O75899	941 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	GNAI3	P08754	354 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	NBPF14	Q5TI25	921 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	IFNLR1	Q8IU57	520 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	CABLES1	Q8TDN4	633 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	LRRCC1	Q9C099	1032 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	NOL7	Q9UMY1	257 aa	Known RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	OVOS2	A0A0G2JMS6	1433 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TNS2	Q63HR2	1409 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	RAD50	Q92878	1312 aa		7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	TRPM3	Q9HCF6	1732 aa	Predicted RBP	7.24	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	NUTM2F	A1L443	756 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	GNAT3	A8MTJ3	354 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	APBB1	O00213	710 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	SGSM2	O43147	1006 aa		7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	GADD45B	O75293	160 aa	Predicted RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	PRPF40A	O75400	957 aa	Known RBP	7.23	□□□□□ -1.25
RDM1-223	ENST00000619193	MCM2	P49736	904 aa		7.23	□□□□□ -1.25

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