RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000617053.2

PNMA8C-201, Transcript of PNMA family member 8C, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene PNMA8C, Length 4,255 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNMA8C-201ENST00000617053 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 ERBB3P21860 1342 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC57Q2TAC2 916 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD44Q8N8A2 993 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 RNF214Q8ND24 703 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 A0A087WZG4 1122 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 RXRBP28702 533 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 CREBRFQ8IUR6 639 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 KIF1BPQ96EK5 621 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 LRRC7Q96NW7 1537 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 CEBPZQ03701 1054 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 LRRFIP1Q32MZ4 808 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 XAGE3Q8WTP9 111 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 SNRKQ9NRH2 765 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.1□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 TCEANC2Q96MN5 208 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 AFF2P51816 1311 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 MSNP26038 577 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 MCM4P33991 863 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 FAM184AQ8NB25 1140 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 KLHDC4Q8TBB5 520 aa11.09□□□□□ -0.63
PNMA8C-201ENST00000617053 H3BQV1 296 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF853P0CG23 659 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 IFFO2Q5TF58 517 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 DCAF5Q96JK2 942 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 TTC22Q5TAA0 569 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 DNAJC10Q8IXB1 793 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SEPT12Q8IYM1 358 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 TRPC5Q9UL62 973 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP2B1P20020 1258 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 DRC7Q8IY82 874 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CEP126Q9P2H0 1117 aa11.08□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RTL1A6NKG5 1358 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 MAP2P11137 1827 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RRP12Q5JTH9 1297 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CEP85Q6P2H3 762 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF790Q6PG37 636 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 VSIG10Q8N0Z9 540 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 DCTPP1Q9H773 170 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SMC3Q9UQE7 1217 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 KIF24Q5T7B8 1368 aa11.07□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 MCM2P49736 904 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SMIM5Q71RC9 77 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ASAP1Q9ULH1 1129 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SIPA1L2Q9P2F8 1722 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 TTC39AQ5SRH9 613 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RAB11FIP3O75154 756 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CCDC158Q5M9N0 1113 aa11.06□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PHKG2P15735 406 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RBM5P52756 815 aaKnown RBP eCLIP11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 TRDNQ13061 729 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ITSN1Q15811 1721 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 USP19O94966 1318 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SDSP20132 328 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PKNOX2Q96KN3 472 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 FERMT3Q86UX7 667 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SLC52A2Q9HAB3 445 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ABCF2Q9UG63 623 aa11.05□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 C6orf229H3BNL8 230 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PIBF1Q8WXW3 757 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 FIBPO43427 364 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 GLRX3O76003 335 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 KSR2Q6VAB6 950 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CPLX1O14810 134 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 ZNF652Q9Y2D9 606 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 KIF3AQ9Y496 699 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 RALYLQ86SE5 291 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 GDPD2Q9HCC8 539 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 USP16Q9Y5T5 823 aa11.04□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 PLEKHM2Q8IWE5 1019 aa11.03□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
PNMA8C-201ENST00000617053 KCNQ2O43526 872 aa11.03□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.4 ms