RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614794.4

SPPL2B-211, Transcript of signal peptide peptidase like 2B, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SPPL2B, Length 1,559 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPPL2B-211ENST00000614794 KIF16BQ96L93 1317 aa28.51■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 ERVV-1B6SEH8 477 aa28.5■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 CAMTA2O94983 1202 aa28.5■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 PLBD2Q8NHP8 589 aa28.5■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP28.5■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 PTPRCP08575 1304 aa28.49■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 ZBTB3Q9H5J0 574 aa28.49■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP28.49■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 RGL2O15211 777 aa28.48■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 USPL1Q5W0Q7 1092 aa28.48■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 KSR2Q6VAB6 950 aa28.48■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 C4AP0C0L4 1744 aa28.48■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 IPO8O15397 1037 aaKnown RBP28.47■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 RIC3Q7Z5B4 369 aa28.47■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 PI4KAP2A4QPH2 592 aa28.46■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa28.46■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP28.46■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF652Q9Y2D9 606 aa28.46■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 CLEC4GQ6UXB4 293 aa28.45■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 ARHGAP45Q92619 1136 aa28.45■■■□□ 2.15
SPPL2B-211ENST00000614794 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP28.45■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP28.44■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 GYS1P13807 737 aa28.44■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP28.44■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 SLC16A10Q8TF71 515 aa28.44■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa28.44■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 ADCY9O60503 1353 aa28.43■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 HLFQ16534 295 aa28.43■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 BCL2L12Q9HB09 334 aa28.43■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa28.42■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP28.42■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 DNAAF4Q8WXU2 420 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 SCN7AQ01118 1682 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 F6X3S4 739 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 NLGN1Q8N2Q7 840 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 BCORQ6W2J9 1755 aa28.41■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 FKBP8Q14318 412 aa28.4■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP28.4■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 TCIRG1Q13488 830 aa28.39■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP28.39■■■□□ 2.14
SPPL2B-211ENST00000614794 TRIM27P14373 513 aa28.37■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 NEXNQ0ZGT2 675 aa28.37■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 NUP98P52948 1817 aa28.37■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 CASZ1Q86V15 1759 aa28.37■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa28.37■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 ATP10DQ9P241 1426 aa28.36■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 TBC1D9BQ66K14 1250 aa28.36■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 SLC4A10Q6U841 1118 aa28.36■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 MYD88Q99836 296 aa28.36■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 MSL1Q68DK7 614 aa28.35■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 ZNF34Q8IZ26 560 aa28.35■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP28.35■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 SETDB2Q96T68 719 aa28.34■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 MTFR1LQ9H019 292 aa28.34■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 PLIN1O60240 522 aa28.33■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 NFIXQ14938 502 aa28.33■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 BICDL1Q6ZP65 573 aa28.33■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 ISCA1Q9BUE6 129 aa28.33■■■□□ 2.13
SPPL2B-211ENST00000614794 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ZBTB7AO95365 584 aa28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 GPTP24298 496 aa28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 TM4SF1P30408 202 aa28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 LINS1Q8NG48 757 aa28.33■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 MS4A1P11836 297 aa28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 BEND3Q5T5X7 828 aa28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CLUAP1Q96AJ1 413 aa28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ABCC4O15439 1325 aa28.32■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 PARP10Q53GL7 1025 aa28.31■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP28.31■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 TNNQ9UQP3 1299 aa28.31■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 PXDNLA1KZ92 1463 aa28.31■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 IGKV5-2P06315 115 aa28.3■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa28.3■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP28.3■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 MMP10P09238 476 aa28.29■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CCT4P50991 539 aaKnown RBP28.29■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 NLRP10Q86W26 655 aa28.29■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CCDC191Q8NCU4 936 aa28.29■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 UBN2Q6ZU65 1347 aa28.29■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 NEURL1BA8MQ27 555 aa28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CARMIL3Q8ND23 1372 aa28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 RNF123Q5XPI4 1314 aa28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ALDH1L1O75891 902 aa28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP28.28■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 PDE3AQ14432 1141 aa28.27■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP28.27■■■□□ 2.12
SPPL2B-211ENST00000614794 DDR1Q08345 913 aa28.26■■■□□ 2.11
SPPL2B-211ENST00000614794 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa28.26■■■□□ 2.11
SPPL2B-211ENST00000614794 PARP3Q9Y6F1 533 aa28.26■■■□□ 2.11
SPPL2B-211ENST00000614794 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP28.25■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 144.6 ms