RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000595081.5

PNKP-205, Transcript of polynucleotide kinase 3'-phosphatase, human

TSL 2

Gene PNKP, Length 513 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PNKP-205	ENST00000595081	DDR1	Q08345	913 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	29.5	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	NFIX	Q14938	502 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	COPS6	Q7L5N1	327 aa		29.5	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	HLF	Q16534	295 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	TRMT2A	Q8IZ69	625 aa	Known RBP	29.49	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		29.49	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	TM4SF1	P30408	202 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	HYPK	Q9NX55	129 aa		29.48	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	CHMP4A	Q9BY43	222 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		29.47	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	KLHL34	Q8N239	644 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		29.46	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	STK31	Q9BXU1	1019 aa		29.45	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	29.45	■■■□□ 2.31
PNKP-205	ENST00000595081	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		29.44	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	FHDC1	Q9C0D6	1143 aa	Predicted RBP	29.44	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	RGL2	O15211	777 aa		29.42	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	SLC4A2	P04920	1241 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	SETDB2	Q96T68	719 aa		29.4	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	SERPINB2	P05120	415 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	29.39	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	G2E3	Q7L622	706 aa		29.39	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	29.39	■■■□□ 2.3
PNKP-205	ENST00000595081	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		29.39	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	NUP98	P52948	1817 aa		29.38	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	GPT	P24298	496 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	SYT17	Q9BSW7	474 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	ATP10D	Q9P241	1426 aa		29.37	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		29.36	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	29.34	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	FAM177B	A6PVY3	158 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	NLGN2	Q8NFZ4	835 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	CD2AP	Q9Y5K6	639 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		29.34	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		29.33	■■■□□ 2.29
PNKP-205	ENST00000595081	FLII	Q13045	1269 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	29.32	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		29.32	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	29.31	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	TCIRG1	Q13488	830 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		29.31	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	CNBD1	Q8NA66	436 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		29.3	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	ADCY9	O60503	1353 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	NPHP1	O15259	732 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	29.29	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		29.29	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	SUSD4	Q5VX71	490 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	ZNF428	Q96B54	188 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		29.28	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	KIF13B	Q9NQT8	1826 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	CACNA1F	O60840	1977 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	KSR2	Q6VAB6	950 aa		29.27	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	29.27	■■■□□ 2.28
PNKP-205	ENST00000595081	PARP10	Q53GL7	1025 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	NLRP10	Q86W26	655 aa		29.26	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	MYD88	Q99836	296 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		29.25	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	ST5	P78524	1137 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		29.24	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	NTSR2	O95665	410 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	NYX	Q9GZU5	481 aa		29.23	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	29.23	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081		A0A0G2JLW4	131 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	TGFB2	P61812	414 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	KIAA1551	Q9HCM1	1747 aa		29.22	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081		F6X3S4	739 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	DPEP1	P16444	411 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	CHRNA5	P30532	468 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	ERFE	Q4G0M1	354 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		29.21	■■■□□ 2.27
PNKP-205	ENST00000595081	WWC3	Q9ULE0	1092 aa		29.21	■■■□□ 2.27

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