RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000594693.5

ZNF548-204, Transcript of zinc finger protein 548, humanhuman

TSL 4

Gene ZNF548, Length 552 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548-204ENST00000594693 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.66■■□□□ 1.22
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ZNF548-204ENST00000594693 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.66■■□□□ 1.22
ZNF548-204ENST00000594693 SPON1Q9HCB6 807 aa22.66■■□□□ 1.22
ZNF548-204ENST00000594693 TM4SF1P30408 202 aa22.65■■□□□ 1.22
ZNF548-204ENST00000594693 PTGER2P43116 358 aa22.65■■□□□ 1.22
ZNF548-204ENST00000594693 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.65■■□□□ 1.22
ZNF548-204ENST00000594693 HLFQ16534 295 aa22.64■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.64■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 G2E3Q7L622 706 aa22.64■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 ALDH1L2Q3SY69 923 aa22.63■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.63■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 SSH1Q8WYL5 1049 aa22.63■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 C4AP0C0L4 1744 aa22.62■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.62■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.62■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 NFIXQ14938 502 aa22.61■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.61■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.61■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 FLIIQ13045 1269 aa22.6■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 POLD1P28340 1107 aa22.59■■□□□ 1.21
ZNF548-204ENST00000594693 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.59■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 COL24A1Q17RW2 1714 aa22.58■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 KSR2Q6VAB6 950 aa22.58■■□□□ 1.21
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ZNF548-204ENST00000594693 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.57■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.57■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 SETDB2Q96T68 719 aa22.57■■□□□ 1.2
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ZNF548-204ENST00000594693 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.56■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.56■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.56■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.56■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22.55■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 PARP3Q9Y6F1 533 aa22.55■■□□□ 1.2
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ZNF548-204ENST00000594693 BCORQ6W2J9 1755 aa22.54■■□□□ 1.2
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ZNF548-204ENST00000594693 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.54■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.54■■□□□ 1.2
ZNF548-204ENST00000594693 ATP10DQ9P241 1426 aa22.54■■□□□ 1.2
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ZNF548-204ENST00000594693 TPTE2Q6XPS3 522 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF548-204ENST00000594693 NLRP10Q86W26 655 aa22.49■■□□□ 1.19
ZNF548-204ENST00000594693 MYD88Q99836 296 aa22.49■■□□□ 1.19
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ZNF548-204ENST00000594693 NUP98P52948 1817 aa22.47■■□□□ 1.19
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ZNF548-204ENST00000594693 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.46■■□□□ 1.19
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ZNF548-204ENST00000594693 CNBD1Q8NA66 436 aa22.45■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.44■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 SLC10A5Q5PT55 438 aa22.42■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP22.42■■□□□ 1.18
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ZNF548-204ENST00000594693 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa22.41■■□□□ 1.18
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