RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590499.1

SMAD4-211, Transcript of SMAD family member 4, humanhuman

TSL 4

Gene SMAD4, Length 545 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD4-211ENST00000590499 LGR6Q9HBX8 967 aa15.01□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa15.01□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 NUDCQ9Y266 331 aa15.01□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 SIPA1L3O60292 1781 aaPredicted RBP15.01□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 RNMTO43148 476 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 PRKAR2BP31323 418 aa15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 ITPK1Q13572 414 aa15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 RALBP1Q15311 655 aa15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 SLC4A9Q96Q91 983 aa15□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 MAP3K5Q99683 1374 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 PSEN2P49810 448 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 LINC00116Q8NCU8 138 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 GAS2L2Q8NHY3 880 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 PHACTR3Q96KR7 559 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 TJP1Q07157 1748 aa14.99□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 UBR2Q8IWV8 1755 aa14.98□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 FCHSD2O94868 740 aa14.98□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 AMIGO3Q86WK7 504 aa14.98□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 SLC16A10Q8TF71 515 aa14.98□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 ATP6V1AP38606 617 aa14.97□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 CEMIPQ8WUJ3 1361 aa14.97□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 KCPQ6ZWJ8 1503 aa14.97□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 GNAT3A8MTJ3 354 aa14.96□□□□□ -0.01
SMAD4-211ENST00000590499 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 IL17REQ8NFR9 667 aa14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PTCD2Q8WV60 388 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 AK7Q96M32 723 aa14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.95□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 FLAD1Q8NFF5 587 aa14.94□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PTCD1O75127 700 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 SSFA2P28290 1259 aa14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 UTRNP46939 3433 aa14.93□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 SLC39A6Q13433 755 aa14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 SMIM5Q71RC9 77 aa14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 GPHNQ9NQX3 736 aaPredicted RBP14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 C4AP0C0L4 1744 aa14.92□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 GNPATO15228 680 aa14.91□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 ARXQ96QS3 562 aa14.91□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 PHF14O94880 888 aa14.9□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP14.9□□□□□ -0.02
SMAD4-211ENST00000590499 FOXK1P85037 733 aa14.89□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 TEFQ10587 303 aa14.89□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP14.89□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 POLD1P28340 1107 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 CRKLP46109 303 aaKnown RBP14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 MSL1Q68DK7 614 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 DNAJC10Q8IXB1 793 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 VSIG10Q8N0Z9 540 aa14.88□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 RPS6KA4O75676 772 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF790Q6PG37 636 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 MCM10Q7L590 875 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 SYT17Q9BSW7 474 aa14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP14.87□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP14.86□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 DSG2Q14126 1118 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 NFE2L2Q16236 605 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 PLPP6Q8IY26 295 aa14.86□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 DCTN1Q14203 1278 aa14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 TRAPPC3LQ5T215 181 aa14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.85□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 KCNQ3O43525 872 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.84□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 CCDC87Q9NVE4 849 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa14.84□□□□□ -0.03
SMAD4-211ENST00000590499 BTBD11A6QL63 1104 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 NEFMP07197 916 aa14.83□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 SOS1Q07889 1333 aaPredicted RBP14.83□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa14.82□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 KIF13BQ9NQT8 1826 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 GYS1P13807 737 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 FMNL2Q96PY5 1086 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa14.81□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.81□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 RFC4P35249 363 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 NLGN2Q8NFZ4 835 aa14.8□□□□□ -0.04
SMAD4-211ENST00000590499 KCNK17Q96T54 332 aa14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.5 ms