RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000584374.1

ITGB4-211, Transcript of integrin subunit beta 4, humanhuman

TSL 3

Gene ITGB4, Length 950 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB4-211ENST00000584374 ERBB4Q15303 1308 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ZBED9Q6R2W3 1325 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 PRR5LQ6MZQ0 368 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 CFAP44Q96MT7 982 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.07■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 HLFQ16534 295 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 WWC1Q8IX03 1113 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 BCS1LQ9Y276 419 aa22.06■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 MYL6BP14649 208 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 PROSER3Q2NL68 480 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 WDR63Q8IWG1 891 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 SETDB2Q96T68 719 aa22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 MBIPQ9NS73 344 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 PIM2Q9P1W9 311 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.04■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ADCY9O60503 1353 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.03■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.03■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP22.03■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 GOLGA2Q08379 1002 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 IFT57Q9NWB7 429 aa22.02■■□□□ 1.12
ITGB4-211ENST00000584374 ATP10DQ9P241 1426 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 ANXA1P04083 346 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 CNBD1Q8NA66 436 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 BRIP1Q9BX63 1249 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 IL16Q14005 1332 aa22.01■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 GNAI1P63096 354 aa22■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 MYH16Q9H6N6 1097 aa22■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 HOXB7P09629 217 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 C2CD5Q86YS7 1000 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 NECTIN2Q92692 538 aa21.99■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.98■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 NUP98P52948 1817 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 E9PSI1 815 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 UBN2Q6ZU65 1347 aa21.97■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 DUSP27Q5VZP5 1158 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 CHPF2Q9P2E5 772 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF521Q96K83 1311 aa21.96■■□□□ 1.11
ITGB4-211ENST00000584374 H0YIN7 160 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 PDE6BP35913 854 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 ST5P78524 1137 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 HDGFL1Q5TGJ6 251 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.95■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 ABCC12Q96J65 1359 aa21.94■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 SRGNP10124 158 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 COPS6Q7L5N1 327 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 TTLL6Q8N841 843 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa21.93■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 FAM177BA6PVY3 158 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 GPTP24298 496 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 TPTE2Q6XPS3 522 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 C8orf58Q8NAV2 365 aa21.92■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 SUSD4Q5VX71 490 aa21.91■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 NPHP1O15259 732 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 NTSR2O95665 410 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 TSPYL6Q8N831 410 aa21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.89■■□□□ 1.1
ITGB4-211ENST00000584374 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 PRELPP51888 382 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 SLFN5Q08AF3 891 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 STYK1Q6J9G0 422 aa21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP21.89■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 ERFEQ4G0M1 354 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 NYXQ9GZU5 481 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.88■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 CDCA7LQ96GN5 454 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 MASTLQ96GX5 879 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 SLX4Q8IY92 1834 aa21.87■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 NFKBIEO00221 500 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 RASSF7Q02833 373 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 CRY2Q49AN0 593 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 PARP10Q53GL7 1025 aa21.86■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 C9orf131Q5VYM1 1079 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.85■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 PLBD2Q8NHP8 589 aa21.85■■□□□ 1.09
ITGB4-211ENST00000584374 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.85■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.6 ms