RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000583289.5

PTPRM-215, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 5

Gene PTPRM, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 NEUROD4Q9HD90 331 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRM-215ENST00000583289 ABCC9O60706 1549 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 TBCELQ5QJ74 424 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 C1orf53Q5VUE5 145 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 MARK1Q9P0L2 795 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 PRR12Q9ULL5 1215 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 GNB5O14775 395 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 MSTNO14793 375 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 BTBD6Q96KE9 485 aa7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 TSPAN10Q9H1Z9 355 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 MAFBQ9Y5Q3 323 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 DGKGP49619 791 aa7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP7.31□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 POTEAQ6S8J7 498 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa7.31□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 A6NJR5 290 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 RASA1P20936 1047 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 LINC00114Q6XXX2 140 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 STRN4Q9NRL3 753 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa7.3□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 SCRIBQ14160 1630 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 SEC13P55735 322 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 CHSY3Q70JA7 882 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 STAG2Q8N3U4 1231 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 TSEN2Q8NCE0 465 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 C7orf43Q8WVR3 580 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 KLF15Q9UIH9 416 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 SFI1A8K8P3 1242 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 HIF1AQ16665 826 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
PTPRM-215ENST00000583289 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.28□□□□□ -1.24
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PTPRM-215ENST00000583289 ALAS2P22557 587 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 COL8A1P27658 744 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 NEUROD1Q13562 356 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 ELOA3Q8NG57 546 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 PPP1R12CQ9BZL4 782 aa7.27□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 BRD7Q9NPI1 651 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 ATAD2Q6PL18 1390 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 KCNQ4P56696 695 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.25□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 SUV39H2Q9H5I1 410 aa7.25□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 SPEM2Q0P670 501 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 TNFRSF25Q93038 417 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 HSH2DQ96JZ2 352 aa7.24□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 USP17L11C9JVI0 530 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 USP17L21D6R901 530 aa7.23□□□□□ -1.25
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PTPRM-215ENST00000583289 USP17L24Q0WX57 530 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 MDFIQ99750 246 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 HINFPQ9BQA5 517 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRM-215ENST00000583289 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa7.23□□□□□ -1.25
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