RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572078.1

SPNS3-202, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 3

Gene SPNS3, Length 463 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-202ENST00000572078 LTBP3Q9NS15 1303 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 SRGNP10124 158 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 ERFEQ4G0M1 354 aa18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.35■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP18.34■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 SETDB2Q96T68 719 aa18.34■□□□□ 0.53
SPNS3-202ENST00000572078 STYK1Q6J9G0 422 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 MCM10Q7L590 875 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 TAOK3Q9H2K8 898 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa18.33■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF26B4DH59 902 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 DDNO94850 711 aaPredicted RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 DCTN1Q14203 1278 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF15Q8N660 670 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 C7orf43Q8WVR3 580 aa18.32■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP18.31■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 DPY19L2Q6NUT2 758 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 OLFM4Q6UX06 510 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 CNKSR1Q969H4 720 aa18.31■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 ST5P78524 1137 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 MASTLQ96GX5 879 aa18.3■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 CAPN15O75808 1086 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 LAMB4A4D0S4 1761 aa18.29■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 PPP2R1AP30153 589 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 CHADLQ6NUI6 762 aa18.28■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP18.28■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF541Q9H0D2 1346 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 SNED1Q8TER0 1413 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 NPHP1O15259 732 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 SNRPA1P09661 255 aaKnown RBP18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 CLEC4GQ6UXB4 293 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 TNS4Q8IZW8 715 aa18.27■□□□□ 0.52
SPNS3-202ENST00000572078 ADAMTSL1Q8N6G6 1762 aa18.27■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 SCN4AP35499 1836 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 DLG5Q8TDM6 1919 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 HLFQ16534 295 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 CFAP53Q96M91 514 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 KDM3BQ7LBC6 1761 aa18.26■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 FAM177BA6PVY3 158 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 SLC51AQ86UW1 340 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 L3MBTL3Q96JM7 780 aaPredicted RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 MIS18AQ9NYP9 233 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 ABCC12Q96J65 1359 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 COL4A5P29400 1685 aa18.25■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 PASKQ96RG2 1323 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 NPR1P16066 1061 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 CCDC93Q567U6 631 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 SOGA3Q5TF21 947 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 CREBZFQ9NS37 354 aa18.24■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 TAF1DQ9H5J8 278 aaPredicted RBP18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 ZNF652Q9Y2D9 606 aa18.23■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 NUP98P52948 1817 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 NUDCQ9Y266 331 aa18.22■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP18.21■□□□□ 0.51
SPNS3-202ENST00000572078 LTBP1Q14766 1721 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 CNTNAP1P78357 1384 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 RGL2O15211 777 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 LDHDQ86WU2 507 aa18.2■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP18.19■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP18.19■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 NUTM1Q86Y26 1132 aa18.19■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 IQCA1LA6NCM1 817 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 CRY2Q49AN0 593 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 RNF123Q5XPI4 1314 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 UBN2Q6ZU65 1347 aa18.18■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 FZD9O00144 591 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 FOXN1O15353 648 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 IARSP41252 1262 aaKnown RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 SYNE4Q8N205 404 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 NGEFQ8N5V2 710 aa18.17■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 C3orf67Q6ZVT6 689 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 RTKN2Q8IZC4 609 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 HACL1Q9UJ83 578 aa18.16■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 EPHX2P34913 555 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 VEGFBP49765 207 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 PLEKHF1Q96S99 279 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa18.15■□□□□ 0.5
SPNS3-202ENST00000572078 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP18.14■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 RIC1Q4ADV7 1423 aa18.14■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 TMEM88BA6NKF7 163 aa18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 ERVV-1B6SEH8 477 aa18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 GPTP24298 496 aa18.13■□□□□ 0.49
SPNS3-202ENST00000572078 ALDH1B1P30837 517 aa18.13■□□□□ 0.49
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