RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568829.1

SPNS1-211, Transcript of sphingolipid transporter 1 (putative), humanhuman

TSL 5

Gene SPNS1, Length 780 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS1-211ENST00000568829 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 KIF6Q6ZMV9 814 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 TSPYL4Q9UJ04 414 aa21.82■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 ERVV-1B6SEH8 477 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NYXQ9GZU5 481 aa21.81■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 ERBB4Q15303 1308 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF26B4DH59 902 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 DPY19L2Q6NUT2 758 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NBPF15Q8N660 670 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NMRK2Q9NPI5 230 aa21.8■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 DLEC1Q9Y238 1755 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 SRGNP10124 158 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 APLP1P51693 650 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 RASSF7Q02833 373 aa21.79■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 C21orf2O43822 256 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 NPR1P16066 1061 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.78■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP21.78■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 BCORQ6W2J9 1755 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 FSTL1Q12841 308 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP21.77■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 TAOK3Q9H2K8 898 aa21.77■■□□□ 1.08
SPNS1-211ENST00000568829 GLTPD2A6NH11 291 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 ALDH1B1P30837 517 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 TMPOP42166 694 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 NGEFQ8N5V2 710 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa21.76■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 RRAGCQ9HB90 399 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 LTBP3Q9NS15 1303 aa21.75■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 DLG5Q8TDM6 1919 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 LAMB4A4D0S4 1761 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 NFKBIEO00221 500 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 MYL6BP14649 208 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 ERFEQ4G0M1 354 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 RUNDC1Q96C34 613 aa21.74■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 FAM177BA6PVY3 158 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 HLFQ16534 295 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC93Q567U6 631 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 KDM3BQ7LBC6 1761 aa21.73■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 SMC1BQ8NDV3 1235 aa21.72■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 NEUROD2Q15784 382 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 SBF1O95248 1867 aa21.71■■□□□ 1.07
SPNS1-211ENST00000568829 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 PARP10Q53GL7 1025 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.7■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 ZBTB3Q9H5J0 574 aa21.69■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 TTLL7Q6ZT98 887 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP21.67■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 CEP350Q5VT06 3117 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 GPTP24298 496 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 ADAMTS8Q9UP79 889 aa21.65■■□□□ 1.06
SPNS1-211ENST00000568829 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 CHL1O00533 1208 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 HOXB7P09629 217 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 PRELPP51888 382 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 CRY2Q49AN0 593 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.64■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 IQCA1LA6NCM1 817 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 NLRP3Q96P20 1036 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.63■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa21.62■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 TIAM2Q8IVF5 1701 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 PDIA6Q15084 440 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 SUSD4Q5VX71 490 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 CFAP44Q96MT7 982 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 SLX4Q8IY92 1834 aa21.61■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 COPS6Q7L5N1 327 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 JDP2Q8WYK2 163 aa21.6■■□□□ 1.05
SPNS1-211ENST00000568829 CRAMP1Q96RY5 1269 aa21.6■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 52.7 ms