RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568316.1

RBBP6-211, Transcript of RB binding protein 6, ubiquitin ligase, human

TSL 5

Gene RBBP6, Length 556 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP6-211	ENST00000568316	CT47B1	P0C2W7	299 aa	Predicted RBP	31.85	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	FKBP8	Q14318	412 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		31.85	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	BCL2L13	Q9BXK5	485 aa		31.84	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	G2E3	Q7L622	706 aa		31.83	■■■□□ 2.69
RBBP6-211	ENST00000568316	HLF	Q16534	295 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	ZNF428	Q96B54	188 aa		31.82	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	SPON1	Q9HCB6	807 aa		31.81	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		31.8	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		31.79	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	FLII	Q13045	1269 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		31.78	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	MRPL50	Q8N5N7	158 aa	Known RBP	31.78	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	MMP10	P09238	476 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	RARS	P54136	660 aa	Known RBP	31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	ALDH1L2	Q3SY69	923 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	TBC1D9B	Q66K14	1250 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		31.77	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	CACNA1F	O60840	1977 aa		31.76	■■■□□ 2.68
RBBP6-211	ENST00000568316	PTGER2	P43116	358 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	NFIX	Q14938	502 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		31.76	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	DDX58	O95786	925 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	POLD1	P28340	1107 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	31.75	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		31.75	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	31.74	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	SGIP1	Q9BQI5	828 aa		31.74	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	NUP98	P52948	1817 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	RGL2	O15211	777 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	DDR1	Q08345	913 aa		31.73	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	TM4SF1	P30408	202 aa		31.72	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	31.72	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	ADCY9	O60503	1353 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	GPT	P24298	496 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		31.71	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	ATP10D	Q9P241	1426 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	KSR2	Q6VAB6	950 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	SETDB2	Q96T68	719 aa		31.7	■■■□□ 2.67
RBBP6-211	ENST00000568316	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		31.69	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	31.68	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	BCAR3	O75815	825 aa		31.68	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	TCIRG1	Q13488	830 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		31.67	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316		F6X3S4	739 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		31.66	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	LRP5	O75197	1615 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	FAM177B	A6PVY3	158 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	MYD88	Q99836	296 aa		31.65	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	31.65	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	SERPINB2	P05120	415 aa		31.64	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	PPP1R1B	Q9UD71	204 aa	Predicted RBP	31.64	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	NOB1	Q9ULX3	412 aa	Known RBP	31.64	■■■□□ 2.66
RBBP6-211	ENST00000568316	BRPF1	P55201	1214 aa	Predicted RBP	31.63	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	DNAAF4	Q8WXU2	420 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	PTPRC	P08575	1304 aa		31.63	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	KIF16B	Q96L93	1317 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		31.62	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	31.61	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		31.61	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	SUSD4	Q5VX71	490 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	NLRP10	Q86W26	655 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	KLHL34	Q8N239	644 aa		31.6	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	FRAT1	Q92837	279 aa	Predicted RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	31.6	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	NPHP1	O15259	732 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	NEXN	Q0ZGT2	675 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	PARP10	Q53GL7	1025 aa		31.59	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	CNBD1	Q8NA66	436 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	NRXN2	Q9P2S2	1712 aa		31.58	■■■□□ 2.65
RBBP6-211	ENST00000568316	IGKV5-2	P06315	115 aa		31.56	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	31.56	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		31.56	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	PPP1R42	Q7Z4L9	355 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		31.55	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	NTSR2	O95665	410 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	TRIM28	Q13263	835 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	UTP14A	Q9BVJ6	771 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	NYX	Q9GZU5	481 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		31.54	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	IPO8	O15397	1037 aa	Known RBP	31.53	■■■□□ 2.64
RBBP6-211	ENST00000568316	LINS1	Q8NG48	757 aa		31.53	■■■□□ 2.64

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 43.8 ms