RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567780.1

HOXC-AS3-204, HOXC cluster antisense RNA 3, humanhuman

Gene HOXC-AS3, Length 2,816 nt, Biotype retained intron.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF445P59923 1031 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GPATCH3Q96I76 525 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GDPD2Q9HCC8 539 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERBB4Q15303 1308 aa14.99□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LINS1Q8NG48 757 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERBB3P21860 1342 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC41PQ6P2S7 1318 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DTNBO60941 627 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MTX1Q13505 466 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TMEM63CQ9P1W3 806 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SYCE3A1L190 88 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF790Q6PG37 636 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KLHDC4Q8TBB5 520 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 DDX54Q8TDD1 881 aaKnown RBP14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HDAC5Q9UQL6 1122 aa14.98□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CASTP20810 708 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CLCN1P35523 988 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 AK2P54819 239 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ERC1Q8IUD2 1116 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CABLES1Q8TDN4 633 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RBSNQ9H1K0 784 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NCAPD2Q15021 1401 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PTH1RQ03431 593 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC173Q0VFZ6 552 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RUFY2Q8WXA3 655 aa14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LMO7Q8WWI1 1683 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KAZALD1Q96I82 304 aa14.96□□□□□ -0.01
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDIA6Q15084 440 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 XAGE3Q8WTP9 111 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C19orf44Q9H6X5 657 aa14.96□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TATP17735 454 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 KCNJ4P48050 445 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEXNQ0ZGT2 675 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CHRNA2Q15822 529 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NAP1L5Q96NT1 182 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 HEG1Q9ULI3 1381 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SASH1O94885 1247 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IGKV5-2P06315 115 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 COPS6Q7L5N1 327 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MYD88Q99836 296 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLC52A2Q9HAB3 445 aa14.95□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ATF3P18847 181 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RUFY3Q7L099 469 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IL17RAQ96F46 866 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 BOLA2Q9H3K6 86 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TLR7Q9NYK1 1049 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NPHP3Q7Z494 1330 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 MBD3O95983 291 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SLIT3O75094 1523 aa14.94□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ADCK5Q3MIX3 580 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EVI5LQ96CN4 794 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FAM227BQ96M60 508 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC14Q96N46 770 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 C1orf167Q5SNV9 1468 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 TTC5Q8N0Z6 440 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 RNF214Q8ND24 703 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PODXL2Q9NZ53 605 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHKG2P15735 406 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP16Q9Y5T5 823 aa14.93□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 SMC3Q9UQE7 1217 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NEURL1BA8MQ27 555 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LARGE1O95461 756 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 LRSAM1Q6UWE0 723 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 USP48Q86UV5 1035 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CCDC83Q8IWF9 413 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PPP1R9BQ96SB3 815 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PDRG1Q9NUG6 133 aa14.92□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 EPHA10Q5JZY3 1008 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 FSD1Q9BTV5 496 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 GCKRQ14397 625 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 IFNL2Q8IZJ0 200 aa14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZSCAN21Q9Y5A6 473 aaPredicted RBP14.91□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa14.9□□□□□ -0.02
HOXC-AS3-204ENST00000567780 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 121.4 ms