RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000564105.5

CTU2-204, Transcript of cytosolic thiouridylase subunit 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CTU2, Length 1,586 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTU2-204ENST00000564105 COL15A1P39059 1388 aa24.36■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 SCN7AQ01118 1682 aa24.36■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.36■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 MS4A1P11836 297 aa24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 FTSJ3Q8IY81 847 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 SPON1Q9HCB6 807 aa24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 ADCY9O60503 1353 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 F6X3S4 739 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 PDE3AQ14432 1141 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 C20orf194Q5TEA3 1177 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 KSR2Q6VAB6 950 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 ARXQ96QS3 562 aa24.34■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 SLC15A2Q16348 729 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.33■■□□□ 1.49
CTU2-204ENST00000564105 ABCC4O15439 1325 aa24.33■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.33■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 PANK1Q8TE04 598 aa24.33■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 A0A087WZG4 1122 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 RLBP1P12271 317 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 DNAAF4Q8WXU2 420 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 STK32BQ9NY57 414 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.32■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP24.31■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 AKT1S1Q96B36 256 aa24.31■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 ZNF827Q17R98 1081 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 SLC4A10Q6U841 1118 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 SMIM5Q71RC9 77 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.3■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 NEFLP07196 543 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 AMIGO3Q86WK7 504 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 PHF14O94880 888 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 ZBTB7AO95365 584 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 TMEM57Q8N5G2 664 aa24.29■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 SSFA2P28290 1259 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 TRAPPC3LQ5T215 181 aa24.28■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 ADRA2BP18089 450 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP24.27■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 TFCP2L1Q9NZI6 479 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 COG6Q9Y2V7 657 aa24.27■■□□□ 1.48
CTU2-204ENST00000564105 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP24.26■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ATP10DQ9P241 1426 aa24.26■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 PTGER2P43116 358 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 CCT4P50991 539 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 INTS3Q68E01 1043 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 CAMTA2O94983 1202 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 NEXNQ0ZGT2 675 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 HLFQ16534 295 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ITPRIPQ8IWB1 547 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 CRBNQ96SW2 442 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 MYD88Q99836 296 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 NARFQ9UHQ1 456 aa24.25■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 RFC4P35249 363 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 MVPQ14764 893 aaKnown RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 BEND3Q5T5X7 828 aa24.24■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ZPR1O75312 459 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa24.23■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 MYH3P11055 1940 aa24.22■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 TCIRG1Q13488 830 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 USPL1Q5W0Q7 1092 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 FLAD1Q8NFF5 587 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 LINS1Q8NG48 757 aa24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 DDX19BQ9UMR2 479 aa24.2■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.2■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 USP42Q9H9J4 1324 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.47
CTU2-204ENST00000564105 COL24A1Q17RW2 1714 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 IGKV5-2P06315 115 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 FKBP8Q14318 412 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 SGIP1Q9BQI5 828 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 PNPLA7Q6ZV29 1317 aa24.2■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 ALDH1L1O75891 902 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 COL23A1Q86Y22 540 aaPredicted RBP24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 MTFR1LQ9H019 292 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 UTRNP46939 3433 aa24.19■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 NEURL1BA8MQ27 555 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 RGL2O15211 777 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 ISCA1Q9BUE6 129 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 BCL2L12Q9HB09 334 aa24.18■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 MSH5O43196 834 aa24.16■■□□□ 1.46
CTU2-204ENST00000564105 GPTP24298 496 aa24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 31 ms