RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000563545.1

CHTF18-214, Transcript of chromosome transmission fidelity factor 18, humanhuman

TSL 5

Gene CHTF18, Length 569 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18-214ENST00000563545 TIAM2Q8IVF5 1701 aa29.49■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 NFKBIEO00221 500 aa29.49■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 ST5P78524 1137 aa29.49■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 APLP1P51693 650 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa29.48■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 SLX4Q8IY92 1834 aa29.47■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 C21orf2O43822 256 aa29.46■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 NFE2L2Q16236 605 aa29.46■■■□□ 2.31
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CHTF18-214ENST00000563545 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP29.45■■■□□ 2.31
CHTF18-214ENST00000563545 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
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CHTF18-214ENST00000563545 SRGNP10124 158 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 STYK1Q6J9G0 422 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 CNKSR1Q969H4 720 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa29.43■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 GLTPD2A6NH11 291 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 MASTLQ96GX5 879 aa29.42■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 THUMPD2Q9BTF0 503 aaKnown RBP29.42■■■□□ 2.3
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CHTF18-214ENST00000563545 FSTL1Q12841 308 aa29.41■■■□□ 2.3
CHTF18-214ENST00000563545 WDR90Q96KV7 1748 aa29.4■■■□□ 2.3
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CHTF18-214ENST00000563545 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP29.39■■■□□ 2.3
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CHTF18-214ENST00000563545 TPTE2Q6XPS3 522 aa29.38■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 FAM177BA6PVY3 158 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 RALBP1Q15311 655 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 NGEFQ8N5V2 710 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 LTBP3Q9NS15 1303 aa29.37■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 TAOK3Q9H2K8 898 aa29.36■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 ERFEQ4G0M1 354 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 SOGA3Q5TF21 947 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP29.35■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 SMC1BQ8NDV3 1235 aa29.34■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP29.33■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 NPR1P16066 1061 aa29.33■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 DPY19L2Q6NUT2 758 aa29.33■■■□□ 2.29
CHTF18-214ENST00000563545 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 ERVV-1B6SEH8 477 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 MYL6BP14649 208 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 C7orf43Q8WVR3 580 aa29.31■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 RIPK4P57078 832 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 HTRA3P83110 453 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 TTLL7Q6ZT98 887 aa29.3■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 KIF6Q6ZMV9 814 aa29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 TSPYL4Q9UJ04 414 aa29.29■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 POTECB2RU33 542 aa29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC93Q567U6 631 aa29.28■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 NYXQ9GZU5 481 aa29.27■■■□□ 2.28
CHTF18-214ENST00000563545 ZBTB3Q9H5J0 574 aa29.26■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 ERBB4Q15303 1308 aa29.25■■■□□ 2.27
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CHTF18-214ENST00000563545 TMPOP42166 694 aaKnown RBP29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 NUTM1Q86Y26 1132 aa29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 ABCC12Q96J65 1359 aa29.25■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 GPTP24298 496 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 ALDH1B1P30837 517 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 OLFM4Q6UX06 510 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 KLRG1Q96E93 195 aa29.23■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 UBN2Q6ZU65 1347 aa29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 DDNO94850 711 aaPredicted RBP29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 BABAM1Q9NWV8 329 aa29.22■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP29.21■■■□□ 2.27
CHTF18-214ENST00000563545 CRY2Q49AN0 593 aa29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 IFFO2Q5TF58 517 aa29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 CCDC146Q8IYE0 955 aa29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 RTKN2Q8IZC4 609 aa29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP29.2■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 PDIA6Q15084 440 aa29.19■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 SUSD4Q5VX71 490 aa29.19■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF34Q8IZ26 560 aa29.19■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP29.19■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 NEUROD2Q15784 382 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 LRP10Q7Z4F1 713 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 RIC1Q4ADV7 1423 aa29.18■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 PROSER3Q2NL68 480 aa29.16■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 SCN4AP35499 1836 aa29.15■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 NTSR2O95665 410 aa29.15■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 ANXA1P04083 346 aa29.15■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 RPGRQ92834 1020 aaKnown RBP29.15■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 SYNE4Q8N205 404 aa29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 JMYQ8N9B5 988 aa29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 RUNDC1Q96C34 613 aa29.14■■■□□ 2.26
CHTF18-214ENST00000563545 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP29.13■■■□□ 2.25
CHTF18-214ENST00000563545 PARP10Q53GL7 1025 aa29.13■■■□□ 2.25
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