RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP7.29□□□□□ -1.24
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RRN3-204ENST00000561685 GAS2L2Q8NHY3 880 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 RHPN1Q8TCX5 695 aa7.29□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 DKK1O94907 266 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 AMPD1P23109 780 aa7.28□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 SNRPNP63162 240 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RRN3-204ENST00000561685 ZNF468Q5VIY5 522 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
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RRN3-204ENST00000561685 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 HIF1AQ16665 826 aa7.27□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa7.26□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 PHACTR1Q9C0D0 580 aa7.26□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 USP17L15C9J2P7 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L10C9JJH3 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L13C9JLJ4 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L12C9JPN9 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L11C9JVI0 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L21D6R901 530 aa7.24□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 USP17L22D6RA61 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L17D6RBQ6 530 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 USP17L19D6RCP7 530 aa7.24□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 GNB5O14775 395 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 C21orf2O43822 256 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 CRTC2Q53ET0 693 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 CHSY3Q70JA7 882 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 FCHSD1Q86WN1 690 aa7.24□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 C2orf49Q9BVC5 232 aaPredicted RBP7.24□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP7.22□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 ELOA3Q8NG57 546 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 HINFPQ9BQA5 517 aa7.22□□□□□ -1.25
RRN3-204ENST00000561685 BRD7Q9NPI1 651 aa7.22□□□□□ -1.25
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RRN3-204ENST00000561685 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa7.19□□□□□ -1.26
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RRN3-204ENST00000561685 CFAP70Q5T0N1 1121 aa7.19□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 MDFIQ99750 246 aa7.19□□□□□ -1.26
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RRN3-204ENST00000561685 FOXO3O43524 673 aa7.18□□□□□ -1.26
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RRN3-204ENST00000561685 ZNF280CQ8ND82 737 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 ARXQ96QS3 562 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 SLC30A3Q99726 388 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 SPOCK3Q9BQ16 436 aa7.18□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP7.18□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 KRBA1A5PL33 1030 aa7.17□□□□□ -1.26
RRN3-204ENST00000561685 TGFBR3LH3BV60 316 aa7.17□□□□□ -1.26
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