RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561438.5

TMOD3-211, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 5

Gene TMOD3, Length 1,139 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-211ENST00000561438 DDX12PQ92771 950 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 SPG7Q9UQ90 795 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 UBR3Q6ZT12 1888 aa10.93□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 RXRBP28702 533 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 AMOTQ4VCS5 1084 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 IFNL2Q8IZJ0 200 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 SLAIN1Q8ND83 568 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 CASZ1Q86V15 1759 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 CACNA1FO60840 1977 aa10.92□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 EXOC5O00471 708 aa10.91□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP10.91□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP10.91□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 A0A0G2JS52 829 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 OSBPP22059 807 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 MYT1Q01538 1121 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 DOK7Q18PE1 504 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 ILDR2Q71H61 639 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 SLC4A9Q96Q91 983 aa10.9□□□□□ -0.66
TMOD3-211ENST00000561438 FANCIQ9NVI1 1328 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 SLFN5Q08AF3 891 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 SLC39A6Q13433 755 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 KRT27Q7Z3Y8 459 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PIGBQ92521 554 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 DCAF5Q96JK2 942 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 SLC52A2Q9HAB3 445 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 MBIPQ9NS73 344 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 HEG1Q9ULI3 1381 aa10.89□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 BCORQ6W2J9 1755 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 C1orf141Q5JVX7 400 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 DUSP27Q5VZP5 1158 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 SLC24A3Q9HC58 644 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ASAP1Q9ULH1 1129 aa10.88□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 CHL1O00533 1208 aa10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 RIMBP2O15034 1052 aa10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 HTATSF1O43719 755 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 TSPYL6Q8N831 410 aa10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PLSCR2Q9NRY7 297 aa10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 QSER1Q2KHR3 1735 aa10.87□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa10.86□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 C8orf58Q8NAV2 365 aa10.86□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ATG3Q9NT62 314 aa10.86□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 NUP98P52948 1817 aa10.86□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 IL16Q14005 1332 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ERVV-2B6SEH9 535 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 KCNQ4P56696 695 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PDE3BQ13370 1112 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 WDR63Q8IWG1 891 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 EPAS1Q99814 870 aa10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP10.85□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 PHF14O94880 888 aa10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 TRIM37O94972 964 aa10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 EIF4A1P60842 406 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 IFT57Q9NWB7 429 aa10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 SCN7AQ01118 1682 aa10.84□□□□□ -0.67
TMOD3-211ENST00000561438 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 CABP4P57796 275 aa10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 AMIGO3Q86WK7 504 aa10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa10.83□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 PALLDQ8WX93 1383 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 BTBD11A6QL63 1104 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 NEFMP07197 916 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 LMOD3Q0VAK6 560 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ITPK1Q13572 414 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF790Q6PG37 636 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ZNF710Q8N1W2 664 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 AK7Q96M32 723 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 TSPYL4Q9UJ04 414 aa10.82□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 SNPHO15079 494 aa10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 TEFQ10587 303 aa10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 ARSIQ5FYB1 569 aa10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 SMIM5Q71RC9 77 aa10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 LRRC4BQ9NT99 713 aa10.81□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 E9PSI1 815 aa10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 GPR37O15354 613 aa10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 PIP4K2AP48426 406 aaPredicted RBP10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 GNAI1P63096 354 aa10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 PROSER3Q2NL68 480 aa10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 FAM196AQ6ZSG2 479 aa10.8□□□□□ -0.68
TMOD3-211ENST00000561438 NGEFQ8N5V2 710 aa10.8□□□□□ -0.68
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.1 ms