RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559573.3

FAM227B-208, Transcript of family with sequence similarity 227 member B, human

TSL 3

Gene FAM227B, Length 2,204 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
FAM227B-208	ENST00000559573	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	JARID2	Q92833	1246 aa	Predicted RBP	13.1	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	NARF	Q9UHQ1	456 aa		13.1	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A0G2JLW4	131 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	IL6ST	P40189	918 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	CARMIL3	Q8ND23	1372 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF521	Q96K83	1311 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	CIC	Q96RK0	1608 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	TWISTNB	Q3B726	338 aa	Predicted RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		13.09	□□□□□ -0.31
FAM227B-208	ENST00000559573	CHRNA5	P30532	468 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC27	Q2M243	656 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC16A10	Q8TF71	515 aa		13.08	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	POLRMT	O00411	1230 aa	Known RBP	13.08	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	LAMB4	A4D0S4	1761 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	ATP5J2-PTCD1	G3V325	749 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	ADRA2B	P18089	450 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	TM4SF1	P30408	202 aa		13.07	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	13.07	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	N4BP2	Q86UW6	1770 aa	Predicted RBP	13.06	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	LRP5	O75197	1615 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	PCNT	O95613	3336 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	NLGN1	Q8N2Q7	840 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	PARP3	Q9Y6F1	533 aa		13.06	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SERPINB2	P05120	415 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	WDR63	Q8IWG1	891 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	AFDN	P55196	1824 aa	Known RBP	13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	VAMP4	O75379	141 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC4A2	P04920	1241 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.05	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	NPHP1	O15259	732 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	NUP98	P52948	1817 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573		F6X3S4	739 aa		13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	YBX3	P16989	372 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	13.04	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	DPEP1	P16444	411 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SLFN5	Q08AF3	891 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SETDB2	Q96T68	719 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	SUSD4	Q5VX71	490 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	BABAM1	Q9NWV8	329 aa		13.03	□□□□□ -0.32
FAM227B-208	ENST00000559573	PRR5L	Q6MZQ0	368 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	OLFM4	Q6UX06	510 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CEP350	Q5VT06	3117 aa		13.02	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	SCN7A	Q01118	1682 aa		13.01	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ERFE	Q4G0M1	354 aa		13.01	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	13.01	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	COL24A1	Q17RW2	1714 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	IL16	Q14005	1332 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573		A0A087WZG4	1122 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	PI4KAP2	A4QPH2	592 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	KCNA3	P22001	575 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	GPR162	Q16538	588 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	PI4KAP1	Q8N8J0	262 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	HCLS1	P14317	486 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CWF19L2	Q2TBE0	894 aa	Known RBP	13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC30	Q5VVM6	783 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	RIC3	Q7Z5B4	369 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CCDC85A	Q96PX6	553 aa	Predicted RBP	13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	MYD88	Q99836	296 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	TNN	Q9UQP3	1299 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	BCS1L	Q9Y276	419 aa		13	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ABCC12	Q96J65	1359 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	12.99	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	FAM89A	Q96GI7	184 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	MAP3K2	Q9Y2U5	619 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	TAF1	P21675	1872 aa		12.99	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CNBD1	Q8NA66	436 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573		E9PSI1	815 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	SSH1	Q8WYL5	1049 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	PXDNL	A1KZ92	1463 aa		12.98	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	STK31	Q9BXU1	1019 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	CACNA1S	Q13698	1873 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ADCY9	O60503	1353 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	BCAR3	O75815	825 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	FLII	Q13045	1269 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	HYPK	Q9NX55	129 aa		12.97	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		12.96	□□□□□ -0.33
FAM227B-208	ENST00000559573	HOXB7	P09629	217 aa		12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	C10orf71	Q711Q0	1435 aa		12.96	□□□□□ -0.34
FAM227B-208	ENST00000559573	NLRP10	Q86W26	655 aa		12.96	□□□□□ -0.34

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