RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558954.5

RABGGTA-208, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit alpha, humanhuman

TSL 4

Gene RABGGTA, Length 570 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTA-208ENST00000558954 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa24.37■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 ANXA1P04083 346 aa24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 KLHL34Q8N239 644 aa24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 TSPYL6Q8N831 410 aa24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 C10orf71Q711Q0 1435 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 CARMIL3Q8ND23 1372 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 E9PSI1 815 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 DDR1Q08345 913 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 NFIXQ14938 502 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC30Q5VVM6 783 aa24.35■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 TM4SF1P30408 202 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 DLEC1Q9Y238 1755 aa24.34■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 HYPKQ9NX55 129 aa24.33■■□□□ 1.49
RABGGTA-208ENST00000558954 TBC1D9BQ66K14 1250 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 BICDL1Q6ZP65 573 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 SYT17Q9BSW7 474 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 CD2APQ9Y5K6 639 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 ATP10DQ9P241 1426 aa24.32■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 XAGE3Q8WTP9 111 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 STK31Q9BXU1 1019 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.31■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 SLFN5Q08AF3 891 aa24.3■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 COPS6Q7L5N1 327 aa24.3■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 SETDB2Q96T68 719 aa24.3■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP24.29■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 HLFQ16534 295 aa24.28■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 SERPINB2P05120 415 aa24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.27■■□□□ 1.48
RABGGTA-208ENST00000558954 VAMP4O75379 141 aa24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 CDCA7LQ96GN5 454 aa24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 CACNA1SQ13698 1873 aa24.26■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 PXDNLA1KZ92 1463 aa24.25■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 CNBD1Q8NA66 436 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 NLGN2Q8NFZ4 835 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 PLBD2Q8NHP8 589 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa24.24■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 NPHP1O15259 732 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 ZBED9Q6R2W3 1325 aa24.23■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 LAMB2P55268 1798 aa24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX58O95786 925 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP24.21■■□□□ 1.47
RABGGTA-208ENST00000558954 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 SLC4A2P04920 1241 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 GPTP24298 496 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 TGFB2P61812 414 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 ST5P78524 1137 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 PRR5LQ6MZQ0 368 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 CHD4Q14839 1912 aa24.2■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 PARP10Q53GL7 1025 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 NYXQ9GZU5 481 aa24.19■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 TCIRG1Q13488 830 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 RIC3Q7Z5B4 369 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 ZNF428Q96B54 188 aa24.18■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 DCAF8L1A6NGE4 600 aa24.17■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.17■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 MYH3P11055 1940 aa24.17■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 FLIIQ13045 1269 aa24.16■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 FAM177BA6PVY3 158 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 G2E3Q7L622 706 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 BRIP1Q9BX63 1249 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 ADCY9O60503 1353 aa24.15■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.14■■□□□ 1.46
RABGGTA-208ENST00000558954 PDE6BP35913 854 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 KSR2Q6VAB6 950 aa24.14■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 A0A0G2JLW4 131 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 DPEP1P16444 411 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 NLRP10Q86W26 655 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 ABCC12Q96J65 1359 aa24.13■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 PI4KAP2A4QPH2 592 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 NTSR2O95665 410 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 SUSD4Q5VX71 490 aa24.12■■□□□ 1.45
RABGGTA-208ENST00000558954 CCDC24Q8N4L8 307 aa24.12■■□□□ 1.45
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