RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558555.5

MEIS3-204, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene MEIS3, Length 1,715 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa30.19■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 PLSCR1O15162 318 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 LINC00116Q8NCU8 138 aa30.18■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 KCNQ4P56696 695 aa30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 R3HDM1Q15032 1099 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 INTS5Q6P9B9 1019 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 TAF1LQ8IZX4 1826 aa30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP30.17■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 SLC27A3Q5K4L6 730 aa30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 PLBD2Q8NHP8 589 aa30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa30.16■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 KIF6Q6ZMV9 814 aa30.15■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 PROM2Q8N271 834 aa30.15■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP30.14■■■□□ 2.42
MEIS3-204ENST00000558555 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa30.14■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 NEXNQ0ZGT2 675 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 TTLL7Q6ZT98 887 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ATP10DQ9P241 1426 aa30.13■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ARXQ96QS3 562 aa30.12■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 EIF5P55010 431 aaKnown RBP30.11■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB7BO15156 539 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 BEND3Q5T5X7 828 aa30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP30.1■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 C4BP0C0L5 1744 aa30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC136Q96JN2 1154 aa30.09■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ALDH1L1O75891 902 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 TXNRD1Q16881 649 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 LINS1Q8NG48 757 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB3Q9H5J0 574 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 LRRC4BQ9NT99 713 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 ZBTB40Q9NUA8 1239 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 DZIP3Q86Y13 1208 aaKnown RBP30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 MYD88Q99836 296 aa30.08■■■□□ 2.41
MEIS3-204ENST00000558555 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 A0A087WZG4 1122 aa30.07■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 COL15A1P39059 1388 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 AK7Q96M32 723 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 GNPATO15228 680 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 RPS6KA4O75676 772 aa30.05■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 GNAI3P08754 354 aa30.04■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa30.04■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP30.04■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 ERVV-1B6SEH8 477 aa30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 MEIS3Q99687 375 aa30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP30.03■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP30.02■■■□□ 2.4
MEIS3-204ENST00000558555 IGKV5-2P06315 115 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa30.01■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 NEURL1BA8MQ27 555 aa30■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP30■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 USP44Q9H0E7 712 aa30■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP30■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 NUP98P52948 1817 aa29.99■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa29.99■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 TCIRG1Q13488 830 aa29.99■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 UBTFL1P0CB47 393 aaPredicted RBP29.98■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 C1orf115Q9H7X2 142 aa29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 HDAC5Q9UQL6 1122 aa29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 PCDHB15Q9Y5E8 787 aa29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa29.97■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 GNAI2P04899 355 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 GCKRQ14397 625 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 HLFQ16534 295 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 ZNF652Q9Y2D9 606 aa29.96■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 UBR3Q6ZT12 1888 aa29.95■■■□□ 2.39
MEIS3-204ENST00000558555 GRM8O00222 908 aa29.95■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 CAMTA2O94983 1202 aa29.95■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 CCDC191Q8NCU4 936 aa29.95■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP29.95■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 BCORQ6W2J9 1755 aa29.95■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 ADRA2BP18089 450 aa29.94■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 TRAPPC3LQ5T215 181 aa29.94■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 ISCA1Q9BUE6 129 aa29.94■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP29.93■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 PDGFDQ9GZP0 370 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 RGL2O15211 777 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 ZPR1O75312 459 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 PHF14O94880 888 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 RWDD1Q9H446 243 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 LRP5O75197 1615 aa29.92■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 NARFQ9UHQ1 456 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 SCN7AQ01118 1682 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 UTYO14607 1347 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 SSFA2P28290 1259 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 RFC4P35249 363 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 CLEC4GQ6UXB4 293 aa29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP29.91■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 SMIM5Q71RC9 77 aa29.9■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP29.9■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 C4AP0C0L4 1744 aa29.89■■■□□ 2.38
MEIS3-204ENST00000558555 SLC15A2Q16348 729 aa29.89■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.1 ms