RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000558455.1

TMOD3-203, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 447 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-203ENST00000558455 TSR2Q969E8 191 aaKnown RBP27.16■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa27.16■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 HLFQ16534 295 aa27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 KIF6Q6ZMV9 814 aa27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 SETDB2Q96T68 719 aa27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGB1Q14789 3259 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa27.15■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 YBX3P16989 372 aaKnown RBP eCLIP27.14■■□□□ 1.942e-8■■□□□ 12.3
TMOD3-203ENST00000558455 CHPF2Q9P2E5 772 aa27.14■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 WWC3Q9ULE0 1092 aa27.14■■□□□ 1.94
TMOD3-203ENST00000558455 A0A0G2JLW4 131 aa27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 ERVV-1B6SEH8 477 aa27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 WDR63Q8IWG1 891 aa27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 C8orf58Q8NAV2 365 aa27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP27.13■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 DPEP1P16444 411 aa27.12■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 ZBTB3Q9H5J0 574 aa27.12■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP27.11■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 MIER1Q8N108 512 aa27.1■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 UTRNP46939 3433 aa27.09■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 PRR5LQ6MZQ0 368 aa27.09■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 TSPYL6Q8N831 410 aa27.09■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 XAGE3Q8WTP9 111 aa27.09■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP27.09■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 COPS6Q7L5N1 327 aa27.08■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 CNBD1Q8NA66 436 aa27.08■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 FANCIQ9NVI1 1328 aa27.08■■□□□ 1.93
TMOD3-203ENST00000558455 ATP10DQ9P241 1426 aa27.07■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 KCNA3P22001 575 aa27.07■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 CHRNA5P30532 468 aa27.07■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP27.07■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC24Q8N4L8 307 aa27.07■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 NPHP1O15259 732 aa27.06■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP27.06■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP27.05■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP27.05■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF521Q96K83 1311 aa27.05■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 GRIN3BO60391 1043 aa27.04■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 HYPKQ9NX55 129 aa27.04■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 NUP98P52948 1817 aa27.04■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 FAM177BA6PVY3 158 aa27.03■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 GPTP24298 496 aa27.03■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 ST5P78524 1137 aa27.03■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 BRIP1Q9BX63 1249 aa27.03■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 UBN2Q6ZU65 1347 aa27.02■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP27.02■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 BCS1LQ9Y276 419 aa27.02■■□□□ 1.92
TMOD3-203ENST00000558455 CCDC30Q5VVM6 783 aa27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 C2CD5Q86YS7 1000 aa27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF34Q8IZ26 560 aa27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 PIM2Q9P1W9 311 aa27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa27.01■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 GOLGA2Q08379 1002 aa27■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 TPTE2Q6XPS3 522 aa27■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 CHMP4AQ9BY43 222 aa27■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 MYH16Q9H6N6 1097 aa27■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 PDE6BP35913 854 aa26.99■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 H0YIN7 160 aa26.98■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 PLBD2Q8NHP8 589 aa26.98■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 NYXQ9GZU5 481 aa26.97■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP26.97■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 YY1P25490 414 aa26.96■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa26.96■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 SUSD4Q5VX71 490 aa26.96■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa26.96■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 DLEC1Q9Y238 1755 aa26.96■■□□□ 1.91
TMOD3-203ENST00000558455 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 TCIRG1Q13488 830 aa26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 PARP10Q53GL7 1025 aa26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 NUTM1Q86Y26 1132 aa26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ABCC12Q96J65 1359 aa26.95■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 STK31Q9BXU1 1019 aa26.94■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 NTSR2O95665 410 aa26.93■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ERFEQ4G0M1 354 aa26.93■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa26.92■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 VAMP4O75379 141 aa26.92■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa26.92■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 CHD4Q14839 1912 aa26.92■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 SRGNP10124 158 aa26.91■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 NLRP10Q86W26 655 aa26.91■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 TTLL6Q8N841 843 aa26.91■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP26.91■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP26.9■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 RIC3Q7Z5B4 369 aa26.9■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa26.9■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa26.89■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP26.89■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 E9PSI1 815 aa26.89■■□□□ 1.9
TMOD3-203ENST00000558455 RIC1Q4ADV7 1423 aa26.89■■□□□ 1.89
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