RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000555834.5

RPS6KL1-211, Transcript of ribosomal protein S6 kinase like 1, humanhuman

TSL 2

Gene RPS6KL1, Length 5,456 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KL1-211ENST00000555834 LIG1P18858 919 aa19.03■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 SNX21Q969T3 373 aa19.03■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 EVI5LQ96CN4 794 aa19.03■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 PTPRCP08575 1304 aa19.03■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC82Q8N4S0 544 aa19.02■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 SSR1P43307 286 aaKnown RBP19.02■□□□□ 0.64
RPS6KL1-211ENST00000555834 TOM1L2Q6ZVM7 507 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NME9Q86XW9 330 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM200AQ8TCP9 573 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC196A0A1B0GTZ2 297 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 TSG101Q99816 390 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 KIF14Q15058 1648 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SDSP20132 328 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 TDRD12Q587J7 1177 aaKnown RBP19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLTMQ9NWH9 1034 aaKnown RBP eCLIP19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLC12A7Q9Y666 1083 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa19.01■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SSRP1Q08945 709 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 HLTFQ14527 1009 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 METTL24Q5JXM2 366 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 GTPBP4Q9BZE4 634 aaKnown RBP19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ALS2CR12Q96Q35 445 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 AKAP2Q9Y2D5 859 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 USP5P45974 858 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ECHDC1Q9NTX5 307 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 DNAI1Q9UI46 699 aa19■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF213O14771 459 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MNAT1P51948 309 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 RAB3GAP1Q15042 981 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SMC1AQ14683 1233 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 HS1BP3Q53T59 392 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SPECC1Q5M775 1068 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYD88Q99836 296 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 GOLGA8AA7E2F4 631 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 LARP1Q6PKG0 1096 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC91Q7Z6B0 441 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NAPBQ9H115 298 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ARFGAP3Q9NP61 516 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NOL12Q9UGY1 213 aaKnown RBP eCLIP18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 V9GYY5 206 aaPredicted RBP18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 PPFIA3O75145 1194 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC175P0C221 793 aa18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NAA15Q9BXJ9 866 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MINDY4BA8MYZ0 360 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 VPS36Q86VN1 386 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NECAB1Q8N987 351 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 GCOM1H8Y6P7 765 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 PPP1R12BO60237 982 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MYZAPP0CAP1 466 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 HNRNPUL1Q9BUJ2 856 aaKnown RBP eCLIP18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MAATS1Q7Z4T9 603 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ABCF2Q9UG63 623 aa18.98■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 FLIIQ13045 1269 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 JADE2Q9NQC1 790 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 GTF2A1P52655 376 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 FAM135AQ9P2D6 1515 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZNF76P36508 570 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 UBASH3AP57075 661 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 NEK1Q96PY6 1258 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MATR3P43243 847 aaKnown RBP eCLIP18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 RSPH14Q9UHP6 348 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 USP16Q9Y5T5 823 aa18.97■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 SLU7O95391 586 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MTIF2P46199 727 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 WWC2Q6AWC2 1192 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 FGFR1OPO95684 399 aaKnown RBP18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MBIPQ9NS73 344 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 IVLP07476 585 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC102BQ68D86 513 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 BBXQ8WY36 941 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 DNAJC25Q9H1X3 360 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 GSTTP1A0A1W2PQM5 241 aa18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 RNF216Q9NWF9 866 aaPredicted RBP18.96■□□□□ 0.63
RPS6KL1-211ENST00000555834 MCM6Q14566 821 aa18.95■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 SMC5Q8IY18 1101 aa18.95■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 ORC3Q9UBD5 711 aaPredicted RBP18.95■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 DACT1Q9NYF0 836 aa18.95■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 IFIT3O14879 490 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGSF3O75054 1194 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 CETN2P41208 172 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 RBM25P49756 843 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 USHBP1Q8N6Y0 703 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 CTCFLQ8NI51 663 aaPredicted RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 SEC63Q9UGP8 760 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 F13A1P00488 732 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 HMG20BQ9P0W2 317 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 HSF2BPO75031 334 aa18.94■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.93■□□□□ 0.62
RPS6KL1-211ENST00000555834 CCDC144CPQ8IYA2 1237 aa18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.3 ms