RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550996.1

CS-222, Transcript of citrate synthase, human

TSL 2

Gene CS, Length 718 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CS-222	ENST00000550996	ERBB4	Q15303	1308 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CS-222	ENST00000550996	RGL2	O15211	777 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CS-222	ENST00000550996	ZNF784	Q8NCA9	323 aa	Predicted RBP	27.27	■■□□□ 1.96
CS-222	ENST00000550996	MBIP	Q9NS73	344 aa		27.27	■■□□□ 1.96
CS-222	ENST00000550996	ANXA1	P04083	346 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	PIM2	Q9P1W9	311 aa		27.26	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	NECTIN2	Q92692	538 aa		27.25	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		27.25	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		27.24	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	DALRD3	Q5D0E6	543 aa	Known RBP	27.23	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	CNBD1	Q8NA66	436 aa		27.23	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	IFT57	Q9NWB7	429 aa		27.23	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	27.23	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	ANKRD31	Q8N7Z5	1873 aa		27.22	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		27.22	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	C2CD5	Q86YS7	1000 aa		27.22	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	BRIP1	Q9BX63	1249 aa		27.22	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		27.21	■■□□□ 1.95
CS-222	ENST00000550996	KIF6	Q6ZMV9	814 aa		27.2	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	27.2	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	ATP10D	Q9P241	1426 aa		27.19	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	ADCY9	O60503	1353 aa		27.19	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	GNAI1	P63096	354 aa		27.18	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	CALD1	Q05682	793 aa	Known RBP	27.18	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	DUSP27	Q5VZP5	1158 aa		27.18	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	FAM177B	A6PVY3	158 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996		H0YIN7	160 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	HOXB7	P09629	217 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	CCDC27	Q2M243	656 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	ARHGAP27	Q6ZUM4	889 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	WWC1	Q8IX03	1113 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		27.17	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	COL11A2	P13942	1736 aa	Predicted RBP	27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	PDE6B	P35913	854 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	ST5	P78524	1137 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	HDGFL1	Q5TGJ6	251 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	DLEC1	Q9Y238	1755 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	ARFGEF1	Q9Y6D6	1849 aa		27.16	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	GPT	P24298	496 aa		27.15	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	XAGE3	Q8WTP9	111 aa		27.15	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	NPHP1	O15259	732 aa		27.14	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	GIGYF2	Q6Y7W6	1299 aa	Known RBP	27.14	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	COPS6	Q7L5N1	327 aa		27.14	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	TTLL6	Q8N841	843 aa		27.14	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	C8orf58	Q8NAV2	365 aa		27.14	■■□□□ 1.94
CS-222	ENST00000550996	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		27.13	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		27.13	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	NUP98	P52948	1817 aa		27.13	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	ABCC12	Q96J65	1359 aa		27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	ELL2	O00472	640 aa	Predicted RBP	27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	SRGN	P10124	158 aa		27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	FAM9B	Q8IZU0	186 aa		27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	TSR2	Q969E8	191 aa	Known RBP	27.12	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	NCBP3	Q53F19	620 aa	Known RBP	27.11	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	ZNF622	Q969S3	477 aa	Known RBP eCLIP	27.11	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	PDZRN3	Q9UPQ7	1066 aa		27.11	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	KLRG2	A4D1S0	409 aa	Predicted RBP	27.1	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	SUSD4	Q5VX71	490 aa		27.1	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	NUTM1	Q86Y26	1132 aa		27.1	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	TSPYL6	Q8N831	410 aa		27.09	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	SALL2	Q9Y467	1007 aa	Predicted RBP	27.09	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	ERFE	Q4G0M1	354 aa		27.08	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	27.08	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	27.08	■■□□□ 1.93
CS-222	ENST00000550996	NTSR2	O95665	410 aa		27.07	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	STYK1	Q6J9G0	422 aa		27.07	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	IL16	Q14005	1332 aa		27.07	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	TNRC6C	Q9HCJ0	1690 aa	Known RBP	27.06	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	PRELP	P51888	382 aa		27.06	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	RASSF7	Q02833	373 aa		27.06	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	MASTL	Q96GX5	879 aa		27.06	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	NYX	Q9GZU5	481 aa		27.06	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	C9orf131	Q5VYM1	1079 aa		27.05	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	PRPF40B	Q6NWY9	871 aa	Known RBP	27.04	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	HYPK	Q9NX55	129 aa		27.04	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	27.04	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	NFKBIE	O00221	500 aa		27.03	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	27.03	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	PARP10	Q53GL7	1025 aa		27.03	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	C21orf2	O43822	256 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	NPR1	P16066	1061 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	TCIRG1	Q13488	830 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	C3orf67	Q6ZVT6	689 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	PLBD2	Q8NHP8	589 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	ZNF526	Q8TF50	670 aa	Predicted RBP	27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	CNKSR1	Q969H4	720 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	SLX4	Q8IY92	1834 aa		27.02	■■□□□ 1.92
CS-222	ENST00000550996	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	FANCI	Q9NVI1	1328 aa		27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	CRY2	Q49AN0	593 aa		27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	NLRP10	Q86W26	655 aa		27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	PHAX	Q9H814	394 aa	Known RBP	27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	SPINK5	Q9NQ38	1064 aa	Predicted RBP	27.01	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	HSP90AB3P	Q58FF7	597 aa		27	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	ANKRD13D	Q6ZTN6	518 aa		27	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	WDR63	Q8IWG1	891 aa		27	■■□□□ 1.91
CS-222	ENST00000550996	C7orf43	Q8WVR3	580 aa		27	■■□□□ 1.91

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