RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550044.1

CS-217, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 546 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-217ENST00000550044 ARHGAP27Q6ZUM4 889 aa13.01□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 KCPQ6ZWJ8 1503 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 NPC1L1Q9UHC9 1359 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 MMP10P09238 476 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 SSFA2P28290 1259 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 FSTL1Q12841 308 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 ADGRD1Q6QNK2 874 aa12.99□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 A0A0G2JLW4 131 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 C9orf131Q5VYM1 1079 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 CFAP44Q96MT7 982 aa12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP12.98□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 PCDH11XQ9BZA7 1347 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 PCDH11YQ9BZA8 1340 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 ARHGAP33O14559 1287 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 FCHSD2O94868 740 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 IL13P35225 146 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.97□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 C10orf71Q711Q0 1435 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 GNPATO15228 680 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 POTEEQ6S8J3 1075 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 LINC00116Q8NCU8 138 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa12.96□□□□□ -0.33
CS-217ENST00000550044 KDM2BQ8NHM5 1336 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 C2orf72A6NCS6 295 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SLC34A2O95436 690 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 PPP2R1AP30153 589 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 TGFB2P61812 414 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SULT6B1Q6IMI4 303 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 AEBP1Q8IUX7 1158 aa12.95□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 CYP27B1O15528 508 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 HMOX1P09601 288 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 DPEP1P16444 411 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 RRAGCQ9HB90 399 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SPG7Q9UQ90 795 aa12.94□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 C4AP0C0L4 1744 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SIK1P57059 783 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SMC1BQ8NDV3 1235 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 PIGBQ92521 554 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 RNF181Q9P0P0 153 aa12.93□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 ITPK1Q13572 414 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 NCAPD2Q15021 1401 aa12.92□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 RNF25Q96BH1 459 aaPredicted RBP12.92□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP12.91□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 FBXO22Q8NEZ5 403 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 CFAP53Q96M91 514 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 CCDC87Q9NVE4 849 aa12.91□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 TK2O00142 265 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 ECM2O94769 699 aaPredicted RBP12.9□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 ATP6V1AP38606 617 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 IFNL2Q8IZJ0 200 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 SBF1O95248 1867 aa12.9□□□□□ -0.34
CS-217ENST00000550044 PHKG2P15735 406 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 TMC2Q8TDI7 906 aa12.89□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 KCNA3P22001 575 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 AMOTQ4VCS5 1084 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 NLGN1Q8N2Q7 840 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 DCAF5Q96JK2 942 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 TMOD3Q9NYL9 352 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 ASAP1Q9ULH1 1129 aa12.88□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 RALBP1Q15311 655 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 DALRD3Q5D0E6 543 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 TRAPPC3LQ5T215 181 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 PIM2Q9P1W9 311 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 NUDCQ9Y266 331 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 PARP3Q9Y6F1 533 aa12.87□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 KDRP35968 1356 aa12.86□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP12.86□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP12.86□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 COL3A1P02461 1466 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 COL5A3P25940 1745 aaPredicted RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 TIAM2Q8IVF5 1701 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 GYS1P13807 737 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 C1orf141Q5JVX7 400 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP12.85□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 RFC4P35249 363 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 RASSF7Q02833 373 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 MTHFSDQ2M296 383 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP12.84□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 STK24Q9Y6E0 443 aa12.84□□□□□ -0.35
CS-217ENST00000550044 HSP90AB1P08238 724 aaKnown RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP12.83□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 CHRNA5P30532 468 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 PRKAR2BP31323 418 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 ATG3Q9NT62 314 aa12.83□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 RGS20O76081 388 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 CABP4P57796 275 aa12.82□□□□□ -0.36
CS-217ENST00000550044 AKAP4Q5JQC9 854 aa12.82□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 131.2 ms