RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000548401.1

LETMD1-216, Transcript of LETM1 domain containing 1, humanhuman

TSL 3

Gene LETMD1, Length 433 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1-216ENST00000548401 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP22.14■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 SLC16A10Q8TF71 515 aa22.14■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ATP10DQ9P241 1426 aa22.14■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 MSH5O43196 834 aa22.13■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 SLC4A2P04920 1241 aa22.13■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 BCL2L13Q9BXK5 485 aa22.13■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ADCY9O60503 1353 aa22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 FLIIQ13045 1269 aa22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 KIF6Q6ZMV9 814 aa22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP22.12■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 NRXN2Q9P2S2 1712 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 LRP5O75197 1615 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ZPR1O75312 459 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ZBTB7AO95365 584 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 FKBP8Q14318 412 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 MTFR1LQ9H019 292 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 SMC4Q9NTJ3 1288 aa22.11■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 HLFQ16534 295 aa22.1■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 MSL1Q68DK7 614 aa22.1■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 PLBD2Q8NHP8 589 aa22.09■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 SGIP1Q9BQI5 828 aa22.09■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 ARXQ96QS3 562 aa22.08■■□□□ 1.13
LETMD1-216ENST00000548401 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP22.08■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 CLEC4GQ6UXB4 293 aa22.07■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP22.07■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa22.07■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF652Q9Y2D9 606 aa22.07■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 PTGER2P43116 358 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 NFIXQ14938 502 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 TBC1D9BQ66K14 1250 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 NLGN1Q8N2Q7 840 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 PXDNLA1KZ92 1463 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 KIF16BQ96L93 1317 aa22.06■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 BCAR3O75815 825 aa22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 DDX58O95786 925 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 DDR1Q08345 913 aa22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 PTPRCP08575 1304 aa22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 UBN2Q6ZU65 1347 aa22.05■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 PI4KAP2A4QPH2 592 aa22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 TM4SF1P30408 202 aa22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 KSR2Q6VAB6 950 aa22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP22.04■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 CARMIL3Q8ND23 1372 aa22.03■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 MMP10P09238 476 aa22.03■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 RCAN3Q9UKA8 241 aa22.03■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa22.03■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 KIF13BQ9NQT8 1826 aa22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 RIC3Q7Z5B4 369 aa22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 ZNF34Q8IZ26 560 aa22.02■■□□□ 1.12
LETMD1-216ENST00000548401 TCIRG1Q13488 830 aa22.01■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 ISCA1Q9BUE6 129 aa22.01■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP22.01■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 SPON1Q9HCB6 807 aa22.01■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 LAMB2P55268 1798 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 F6X3S4 739 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 DNAAF4Q8WXU2 420 aa22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 NOB1Q9ULX3 412 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP22■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 C10orf71Q711Q0 1435 aa21.99■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa21.99■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 GPTP24298 496 aa21.99■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.99■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa21.98■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 ARHGAP45Q92619 1136 aa21.98■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 MYD88Q99836 296 aa21.98■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 IGKV5-2P06315 115 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 POLD1P28340 1107 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 NLRP10Q86W26 655 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 SETDB2Q96T68 719 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 ABCC4O15439 1325 aa21.97■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 TRIM27P14373 513 aa21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 TNNQ9UQP3 1299 aa21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
LETMD1-216ENST00000548401 NTSR2O95665 410 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 PARP10Q53GL7 1025 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 BEND3Q5T5X7 828 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 SUSD4Q5VX71 490 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 PARP3Q9Y6F1 533 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 ABCC12Q96J65 1359 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 RIC1Q4ADV7 1423 aa21.95■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 SERPINB2P05120 415 aa21.94■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP21.94■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 LINS1Q8NG48 757 aa21.94■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
LETMD1-216ENST00000548401 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.94■■□□□ 1.1
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