RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546969.1

CASP9-211, Transcript of caspase 9, humanhuman

TSL 2

Gene CASP9, Length 569 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9-211ENST00000546969 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP22.16■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NGEFQ8N5V2 710 aa22.16■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NBPF15Q8N660 670 aa22.16■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 CNKSR1Q969H4 720 aa22.16■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 NEUROD2Q15784 382 aa22.15■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 KDM2BQ8NHM5 1336 aa22.14■■□□□ 1.14
CASP9-211ENST00000546969 CCDC146Q8IYE0 955 aa22.14■■□□□ 1.13
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CASP9-211ENST00000546969 ERVV-1B6SEH8 477 aa22.13■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP22.13■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 CCDC24Q8N4L8 307 aa22.13■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 MYL6BP14649 208 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 LMNB1P20700 586 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 SOGA3Q5TF21 947 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 STYK1Q6J9G0 422 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 MASTLQ96GX5 879 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 NYXQ9GZU5 481 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 BCORQ6W2J9 1755 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 KDM3BQ7LBC6 1761 aa22.12■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 LAMB4A4D0S4 1761 aa22.11■■□□□ 1.13
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CASP9-211ENST00000546969 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP22.1■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa22.09■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 FAM177BA6PVY3 158 aa22.09■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP22.09■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 ADAMTS8Q9UP79 889 aa22.09■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 DLEC1Q9Y238 1755 aa22.09■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 C21orf2O43822 256 aa22.08■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 SRGNP10124 158 aa22.08■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 NPR1P16066 1061 aa22.08■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 RASSF7Q02833 373 aa22.08■■□□□ 1.13
CASP9-211ENST00000546969 KIF3CO14782 793 aa22.07■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 HLFQ16534 295 aa22.07■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 TOMM70O94826 608 aa22.06■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP22.06■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa22.05■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP22.05■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 ZBTB3Q9H5J0 574 aa22.05■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 ALDH1B1P30837 517 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 DPY19L2Q6NUT2 758 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 TTLL7Q6ZT98 887 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 TAOK3Q9H2K8 898 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 NMRK2Q9NPI5 230 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 SBF1O95248 1867 aa22.04■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 CHL1O00533 1208 aa22.03■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 HSPA6P17066 643 aa22.03■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa22.03■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 GPTP24298 496 aa22.02■■□□□ 1.12
CASP9-211ENST00000546969 PARP10Q53GL7 1025 aa22.02■■□□□ 1.12
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CASP9-211ENST00000546969 CCDC93Q567U6 631 aa22.01■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa22.01■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 TRIM35Q9UPQ4 493 aa22.01■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP22■■□□□ 1.11
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CASP9-211ENST00000546969 RRAGCQ9HB90 399 aa22■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 LTBP3Q9NS15 1303 aa22■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 NUP98P52948 1817 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 GLTPD2A6NH11 291 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 HOXB7P09629 217 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 NECTIN2Q92692 538 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 CFAP44Q96MT7 982 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP21.99■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP21.98■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 NUTM1Q86Y26 1132 aa21.98■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.98■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.98■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP21.98■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP21.97■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 APAF1O14727 1248 aa21.97■■□□□ 1.11
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CASP9-211ENST00000546969 ZNF34Q8IZ26 560 aa21.97■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa21.96■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 APLP1P51693 650 aa21.96■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 GNAI1P63096 354 aa21.96■■□□□ 1.11
CASP9-211ENST00000546969 PDIA6Q15084 440 aa21.96■■□□□ 1.11
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CASP9-211ENST00000546969 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
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CASP9-211ENST00000546969 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 ANP32CO43423 234 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 FSTL1Q12841 308 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 SUSD4Q5VX71 490 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 CC2D2BQ6DHV5 1058 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 XAGE3Q8WTP9 111 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 RBM17Q96I25 401 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 NLRP3Q96P20 1036 aa21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP21.95■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 CACNA1SQ13698 1873 aa21.94■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 ANXA1P04083 346 aa21.94■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 GRIPAP1Q4V328 841 aa21.94■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 IFT57Q9NWB7 429 aa21.94■■□□□ 1.1
CASP9-211ENST00000546969 RNF123Q5XPI4 1314 aa21.94■■□□□ 1.1
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