RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000545204.1

MDM2-233, Transcript of MDM2 proto-oncogene, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM2, Length 398 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM2-233	ENST00000545204	PCDHGC4	Q9Y5F7	938 aa		6.07	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ATXN7	O15265	892 aa	Predicted RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	PRMT3	O60678	531 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	SLURP2	P0DP57	97 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	SRSF11	Q05519	484 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	CLP1	Q92989	425 aa	Known RBP	6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	PRIMPOL	Q96LW4	560 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ARID3A	Q99856	593 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	GJA3	Q9Y6H8	435 aa		6.06	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ADAMTS2	O95450	1211 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	FAM157B	P0CG42	384 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	MX2	P20592	715 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	FKBP5	Q13451	457 aa	Predicted RBP	6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	RTN1	Q16799	776 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC69	Q6ZNQ3	347 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ZSCAN1	Q8NBB4	408 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	NGLY1	Q96IV0	654 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	SLAIN2	Q9P270	581 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	HCN2	Q9UL51	889 aa		6.05	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	DCDC2B	A2VCK2	349 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	EFS	O43281	561 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	MAPT	P10636	758 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	FGFR3	P22607	806 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	TNP2	Q05952	138 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	CXXC1	Q9P0U4	656 aa	Predicted RBP	6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	IGF1R	P08069	1367 aa		6.04	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	KHNYN	O15037	678 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF280C	Q8ND82	737 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	VTI1A	Q96AJ9	217 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	SUSD3	Q96L08	255 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	NEUROD4	Q9HD90	331 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ANKIB1	Q9P2G1	1089 aa		6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	NSFL1C	Q9UNZ2	370 aa	Known RBP	6.03	□□□□□ -1.44
MDM2-233	ENST00000545204	ATP2B4	P23634	1241 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	MAP2K3	P46734	347 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CTBS	Q01459	385 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	HIF1A	Q16665	826 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	COL26A1	Q96A83	441 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	MYO19	Q96H55	970 aa		6.02	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	C2CD2L	O14523	706 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	BMP4	P12644	408 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CD33	P20138	364 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	TYRO3	Q06418	890 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	LAMC2	Q13753	1193 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	FAM182B	Q5T319	152 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	IER5	Q5VY09	327 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF385C	Q66K41	422 aa	Predicted RBP	6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	WHAMM	Q8TF30	809 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	UTP3	Q9NQZ2	479 aa	Known RBP eCLIP	6.01	□□□□□ -1.45	1e-8	■■■■■ 50.5
MDM2-233	ENST00000545204	STRN4	Q9NRL3	753 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	BCS1L	Q9Y276	419 aa		6.01	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	TGFBR3L	H3BV60	316 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	DGKZ	Q13574	1117 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CAPN12	Q6ZSI9	719 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	BTLA	Q7Z6A9	289 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	ACD	Q96AP0	544 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CEP63	Q96MT8	703 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	MKNK1	Q9BUB5	465 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	KLK14	Q9P0G3	267 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	MARK1	Q9P0L2	795 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	LRFN2	Q9ULH4	789 aa		6	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CARNS1	A5YM72	827 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	COX20	Q5RI15	118 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	LYPD4	Q6UWN0	246 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	SVOP	Q8N4V2	548 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	OXCT2	Q9BYC2	517 aa	Predicted RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	BRD7	Q9NPI1	651 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	DMGDH	Q9UI17	866 aa	Known RBP	5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	UST	Q9Y2C2	406 aa		5.99	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	PTCD1	O75127	700 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	CELA2B	P08218	269 aa	Predicted RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	KCNQ4	P56696	695 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	SFSWAP	Q12872	951 aa	Known RBP	5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	C11orf91	Q3C1V1	193 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	C16orf46	Q6P387	395 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	SAP130	Q9H0E3	1048 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	LRRC4B	Q9NT99	713 aa		5.98	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	FAM181B	A6NEQ2	426 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	ARHGEF15	O94989	841 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	ARAF	P10398	606 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	BCR	P11274	1271 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	SSFA2	P28290	1259 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	GRIN2C	Q14957	1233 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	AVEN	Q9NQS1	362 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	GDF2	Q9UK05	429 aa	Predicted RBP	5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	KCNH4	Q9UQ05	1017 aa		5.97	□□□□□ -1.45
MDM2-233	ENST00000545204	TNFRSF10B	O14763	440 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	OIP5	O43482	229 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	INPP5B	P32019	993 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	IDH3A	P50213	366 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	MAP3K10	Q02779	954 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	ZNF468	Q5VIY5	522 aa	Predicted RBP	5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	PHLDB3	Q6NSJ2	640 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	SLCO4C1	Q6ZQN7	724 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	GOLGA6L1	Q8N7Z2	621 aa		5.96	□□□□□ -1.46
MDM2-233	ENST00000545204	RETREG2	Q8NC44	543 aa		5.96	□□□□□ -1.46

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