RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541667.5

CLSTN3-211, Transcript of calsyntenin 3, humanhuman

TSL 4

Gene CLSTN3, Length 671 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLSTN3-211ENST00000541667 TMPOP42166 694 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RIPK4P57078 832 aa15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 LRP10Q7Z4F1 713 aa15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP15.62■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 C21orf2O43822 256 aa15.61■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 STYK1Q6J9G0 422 aa15.61■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TTLL7Q6ZT98 887 aa15.61■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RRAGCQ9HB90 399 aa15.61■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 SLX4Q8IY92 1834 aa15.6■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 PDIA6Q15084 440 aa15.6■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP15.6■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.6■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 POTECB2RU33 542 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ERVV-1B6SEH8 477 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ST5P78524 1137 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 TPTE2Q6XPS3 522 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 MASTLQ96GX5 879 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF652Q9Y2D9 606 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC88AQ3V6T2 1871 aa15.59■□□□□ 0.09
CLSTN3-211ENST00000541667 GLTPD2A6NH11 291 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NGEFQ8N5V2 710 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CNKSR1Q969H4 720 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 BABAM1Q9NWV8 329 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ADAMTS8Q9UP79 889 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TRIM35Q9UPQ4 493 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 KDM2BQ8NHM5 1336 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FER1L6Q2WGJ9 1857 aa15.58■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LAMB4A4D0S4 1761 aa15.57■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC146Q8IYE0 955 aa15.57■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TSPYL4Q9UJ04 414 aa15.57■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa15.57■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FAM177BA6PVY3 158 aa15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CHL1O00533 1208 aa15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 MYL6BP14649 208 aa15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF34Q8IZ26 560 aa15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 LTBP3Q9NS15 1303 aa15.56■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ERBB4Q15303 1308 aa15.55■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 UBN2Q6ZU65 1347 aa15.55■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NPR1P16066 1061 aa15.55■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 PROSER3Q2NL68 480 aa15.55■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 OLFM4Q6UX06 510 aa15.55■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NUP98P52948 1817 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 KRT24Q2M2I5 525 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 CRY2Q49AN0 593 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SUSD4Q5VX71 490 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NUTM1Q86Y26 1132 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 RUNDC1Q96C34 613 aa15.54■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NPHP1O15259 732 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ANXA1P04083 346 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 APLP1P51693 650 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 FSTL1Q12841 308 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 NEUROD2Q15784 382 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ERFEQ4G0M1 354 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ZBTB3Q9H5J0 574 aa15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 DICER1Q9UPY3 1922 aaKnown RBP15.53■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 ABCC12Q96J65 1359 aa15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 GPTP24298 496 aa15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 TAOK3Q9H2K8 898 aa15.52■□□□□ 0.08
CLSTN3-211ENST00000541667 SNED1Q8TER0 1413 aa15.51■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NTSR2O95665 410 aa15.51■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP15.51■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 LMOD3Q0VAK6 560 aa15.51■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C3orf67Q6ZVT6 689 aa15.51■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 HTRA3P83110 453 aa15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SOGA3Q5TF21 947 aa15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 KIF6Q6ZMV9 814 aa15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NYXQ9GZU5 481 aa15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CACNA1SQ13698 1873 aa15.5■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ALDH1B1P30837 517 aa15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 CCDC93Q567U6 631 aa15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC10A5Q5PT55 438 aa15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 COPS6Q7L5N1 327 aa15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 SLC51AQ86UW1 340 aa15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP15.49■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 TIAM2Q8IVF5 1701 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 WDR90Q96KV7 1748 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DDNO94850 711 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 ZNF853P0CG23 659 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DPY19L2Q6NUT2 758 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 NECTIN2Q92692 538 aa15.48■□□□□ 0.07
CLSTN3-211ENST00000541667 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 90.7 ms