RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532564.6

GMDS-AS1-210, humanhuman

TSL 3

Gene GMDS-AS1, Length 1,436 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRR20DP86480 221 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRR20BP86481 221 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRR20AP86496 221 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RALBP1Q15311 655 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KRT28Q7Z3Y7 464 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRR7Q8TB68 274 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PARD3Q8TEW0 1356 aa11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MARF1Q9Y4F3 1742 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PIP4K2BP78356 416 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TRIM32Q13049 653 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NUTM2GQ5VZR2 741 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NUDT12Q9BQG2 462 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PHLPP1O60346 1717 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NPHP3Q7Z494 1330 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TTC21AQ8NDW8 1320 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SSH2Q76I76 1423 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 IQSEC2Q5JU85 1478 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ALS2Q96Q42 1657 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 UBAP1LF5GYI3 381 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TOM1O60784 492 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 COG3Q96JB2 828 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.43□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPDYE5A6NIY4 337 aa11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ABTB2Q8N961 1025 aa11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PKD2L1Q9P0L9 805 aa11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LIMD1Q9UGP4 676 aa11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PXDNQ92626 1479 aa11.42□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LCE2BO14633 110 aa11.41□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP11.41□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 USP54Q70EL1 1684 aa11.41□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CABLES1Q8TDN4 633 aa11.41□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ZBTB3Q9H5J0 574 aa11.41□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LTN1O94822 1766 aa11.4□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PPP2R1AP30153 589 aa11.4□□□□□ -0.58
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CFAP99D6REC4 459 aa11.39□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CCNYL3P0C7X3 344 aa11.39□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TNS3Q68CZ2 1445 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 OVOS2Q6IE36 1432 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SBNO1A3KN83 1393 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TRAF7Q6Q0C0 670 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MRS2Q9HD23 443 aa11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 AHDC1Q5TGY3 1603 aaPredicted RBP11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP11.38□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CCER2I3L3R5 266 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FBLN1P23142 703 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CLK2P49760 499 aaKnown RBP11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 QPCTQ16769 361 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PTPRNQ16849 979 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PKDCCQ504Y2 493 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CCDC184Q52MB2 194 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NLRP13Q86W25 1043 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 USP31Q70CQ4 1352 aa11.37□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAM187AA6NFU0 413 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PRPF38BQ5VTL8 546 aaKnown RBP11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PTCRAQ6ISU1 281 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAM117AQ9C073 453 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 POLR3EQ9NVU0 708 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ABCA3Q99758 1704 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SOS2Q07890 1332 aaPredicted RBP11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SPATA31A3Q5VYP0 1347 aa11.36□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ZBTB7CA1YPR0 619 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 DESI1Q6ICB0 168 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NUTM2AQ8IVF1 878 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 ARHGEF10O15013 1369 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MTHFSP49914 203 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RRS1Q15050 365 aaKnown RBP11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TSC1Q92574 1164 aa11.35□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 RGPD5Q99666 1765 aa11.34□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 PEAK1Q9H792 1746 aa11.34□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.34□□□□□ -0.59
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SLIT3O75094 1523 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 WNT7AO00755 349 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SKOR1P84550 965 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TUSC1Q2TAM9 212 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CYP4X1Q8N118 509 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 CFAP53Q96M91 514 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 SHPRHQ149N8 1683 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 NFAT5O94916 1531 aa11.33□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LILRB3O75022 631 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 DGAT1O75907 488 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 TPRNQ4KMQ1 711 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 FAM9BQ8IZU0 186 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 KCNH5Q8NCM2 988 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 UNC93B1Q9H1C4 597 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 EVA1BQ9NVM1 165 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 POLKQ9UBT6 870 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 AATKQ6ZMQ8 1374 aa11.32□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 USP19O94966 1318 aa11.31□□□□□ -0.6
GMDS-AS1-210ENST00000532564 AMPHP49418 695 aa11.31□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.9 ms