RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531524.5

BSCL2-223, Transcript of BSCL2, seipin lipid droplet biogenesis associated, human

TSL 3

Gene BSCL2, Length 844 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
BSCL2-223	ENST00000531524	TAF1D	Q9H5J8	278 aa	Predicted RBP	6.71	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PRDM10	Q9NQV6	1147 aa		6.71	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	TBC1D2B	Q9UPU7	963 aa		6.71	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	VIRMA	Q69YN4	1812 aa	Known RBP	6.71	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC88A	Q3V6T2	1871 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ADAMTSL1	Q8N6G6	1762 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ARFGEF2	Q9Y6D5	1785 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NBPF26	B4DH59	902 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	KCNQ3	O43525	872 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	DDN	O94850	711 aa	Predicted RBP	6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	BICDL1	Q6ZP65	573 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	LDHD	Q86WU2	507 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC24	Q8N4L8	307 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NBPF15	Q8N660	670 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PHACTR3	Q96KR7	559 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	SETDB2	Q96T68	719 aa		6.7	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	IQCA1L	A6NCM1	817 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	FZD9	O00144	591 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	FOXN1	O15353	648 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	TEF	Q10587	303 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CRY2	Q49AN0	593 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	RSPH6A	Q9H0K4	717 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	WBP1L	Q9NX94	342 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	USP16	Q9Y5T5	823 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF541	Q9H0D2	1346 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	BCOR	Q6W2J9	1755 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	SCN4A	P35499	1836 aa		6.69	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	RASSF10	A6NK89	507 aa		6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	SNRPA1	P09661	255 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NPR1	P16066	1061 aa		6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	VEGFB	P49765	207 aa		6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ST5	P78524	1137 aa		6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	FKBP4	Q02790	459 aa	Known RBP eCLIP	6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CCDC93	Q567U6	631 aa		6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	DZIP3	Q86Y13	1208 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	MKRN1	Q9UHC7	482 aa	Known RBP	6.68	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	RIC1	Q4ADV7	1423 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	TMEM88B	A6NKF7	163 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	BTBD11	A6QL63	1104 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	HTATSF1	O43719	755 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CAPN15	O75808	1086 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	HOXA10	P31260	410 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CTCF	P49711	727 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CC2D1B	Q5T0F9	858 aa	Known RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	OLFM4	Q6UX06	510 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	TPTE2	Q6XPS3	522 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	RTKN2	Q8IZC4	609 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PSMD1	Q99460	953 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PCGF6	Q9BYE7	350 aa		6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF219	Q9P2Y4	722 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	6.67	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	COL4A5	P29400	1685 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PRKAR2B	P31323	418 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	EPHX2	P34913	555 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PNMA8A	Q86V59	439 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	GPC2	Q8N158	579 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF277	Q9NRM2	450 aa	Predicted RBP	6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	HACL1	Q9UJ83	578 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ABCC12	Q96J65	1359 aa		6.66	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	U2SURP	O15042	1029 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	HSPA8	P11142	646 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	IARS	P41252	1262 aa	Known RBP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PIP4K2A	P48426	406 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	HLF	Q16534	295 aa		6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	GRIPAP1	Q4V328	841 aa		6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	CNTROB	Q8N137	903 aa		6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	SYNE4	Q8N205	404 aa		6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	NIP7	Q9Y221	180 aa	Known RBP eCLIP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	6.65	□□□□□ -1.34
BSCL2-223	ENST00000531524	PDE4DIP	Q5VU43	2346 aa		6.65	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	THSD7B	Q9C0I4	1608 aa		6.65	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	ALDH1B1	P30837	517 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	SCNN1D	P51172	638 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	MCM10	Q7L590	875 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	LRP10	Q7Z4F1	713 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	LTBP1	Q14766	1721 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	CACNA1S	Q13698	1873 aa		6.64	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	SLC34A2	O95436	690 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	PPP2R1A	P30153	589 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	RGS19	P49795	217 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	LBX1	P52954	281 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	MAP2K1	Q02750	393 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	TAF7	Q15545	349 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	DEFB115	Q30KQ5	88 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	CST9	Q5W186	159 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	RNF123	Q5XPI4	1314 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	MAP1S	Q66K74	1059 aa	Predicted RBP	6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	MAP3K15	Q6ZN16	1313 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	ZNF34	Q8IZ26	560 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	WDR33	Q9C0J8	1336 aa	Known RBP	6.63	□□□□□ -1.35
BSCL2-223	ENST00000531524	DDX21	Q9NR30	783 aa	Known RBP eCLIP	6.63	□□□□□ -1.35

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