RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000527622.5

CTTN-211, Transcript of cortactin, humanhuman

TSL 4

Gene CTTN, Length 597 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTN-211ENST00000527622 NFKBIEO00221 500 aa24.93■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 PDE6BP35913 854 aa24.92■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa24.92■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 HSPA6P17066 643 aa24.9■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP24.9■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP24.89■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 HLFQ16534 295 aa24.89■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 ZNF652Q9Y2D9 606 aa24.89■■□□□ 1.58
CTTN-211ENST00000527622 SRGNP10124 158 aa24.88■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP24.88■■□□□ 1.572e-6■□□□□ 10.8
CTTN-211ENST00000527622 LMNB1P20700 586 aa24.87■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 TMPOP42166 694 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 ST5P78524 1137 aa24.87■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 TOMM70O94826 608 aa24.86■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 STYK1Q6J9G0 422 aa24.86■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP24.86■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP24.86■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP24.85■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 RIPK4P57078 832 aa24.85■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 C21orf2O43822 256 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 TTLL7Q6ZT98 887 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 LRP10Q7Z4F1 713 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 KDM2BQ8NHM5 1336 aa24.84■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 WDR90Q96KV7 1748 aa24.83■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 ABCC12Q96J65 1359 aa24.83■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP24.83■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 MASTLQ96GX5 879 aa24.83■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 TSPYL4Q9UJ04 414 aa24.83■■□□□ 1.57
CTTN-211ENST00000527622 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa24.83■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 LTBP3Q9NS15 1303 aa24.83■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 ERVV-1B6SEH8 477 aa24.82■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 ERBB4Q15303 1308 aa24.82■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 CCDC146Q8IYE0 955 aa24.81■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 C7orf43Q8WVR3 580 aa24.81■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 CNKSR1Q969H4 720 aa24.81■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP24.81■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 NPHP1O15259 732 aa24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 BABAM1Q9NWV8 329 aa24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 UBN2Q6ZU65 1347 aa24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP24.8■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 RIC1Q4ADV7 1423 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 SNED1Q8TER0 1413 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 PDIA6Q15084 440 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 TPTE2Q6XPS3 522 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 NGEFQ8N5V2 710 aa24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP24.79■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 GLTPD2A6NH11 291 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 MYL6BP14649 208 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 RRAGCQ9HB90 399 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 TRIM35Q9UPQ4 493 aa24.78■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 PCNTO95613 3336 aa24.77■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 FAM177BA6PVY3 158 aa24.77■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 NPR1P16066 1061 aa24.77■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 LMOD3Q0VAK6 560 aa24.77■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 PROSER3Q2NL68 480 aa24.77■■□□□ 1.56
CTTN-211ENST00000527622 LAMB2P55268 1798 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 RUNDC1Q96C34 613 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 ZBTB3Q9H5J0 574 aa24.76■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 CRY2Q49AN0 593 aa24.75■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 KIF6Q6ZMV9 814 aa24.75■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.75■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 POTECB2RU33 542 aa24.74■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 NUTM1Q86Y26 1132 aa24.74■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 ZNF34Q8IZ26 560 aa24.74■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 CHL1O00533 1208 aa24.73■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 ANXA1P04083 346 aa24.73■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 KRT24Q2M2I5 525 aa24.73■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP24.73■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 GPTP24298 496 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 APLP1P51693 650 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 NEUROD2Q15784 382 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 ERFEQ4G0M1 354 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 SOGA3Q5TF21 947 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 OLFM4Q6UX06 510 aa24.72■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 NTSR2O95665 410 aa24.71■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 FSTL1Q12841 308 aa24.71■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 SUSD4Q5VX71 490 aa24.71■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 NYXQ9GZU5 481 aa24.71■■□□□ 1.55
CTTN-211ENST00000527622 EIF2S2P20042 333 aaKnown RBP24.7■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 CCDC93Q567U6 631 aa24.7■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP24.7■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 DNAJC5GQ8N7S2 189 aa24.69■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 SCN4AP35499 1836 aa24.68■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP24.68■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 COL4A5P29400 1685 aa24.67■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 C3orf67Q6ZVT6 689 aa24.67■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 HOXA10P31260 410 aaPredicted RBP24.66■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP24.66■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 SLC51AQ86UW1 340 aa24.66■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP24.65■■□□□ 1.54
CTTN-211ENST00000527622 SMC1BQ8NDV3 1235 aa24.65■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.4 ms