RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000525127.1

BRMS1-204, Transcript of BRMS1, transcriptional repressor and anoikis regulator, humanhuman

TSL 2

Gene BRMS1, Length 750 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRMS1-204ENST00000525127 CHRNA5P30532 468 aa19.1■□□□□ 0.65
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BRMS1-204ENST00000525127 SETDB2Q96T68 719 aa19.1■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 MYH16Q9H6N6 1097 aa19.1■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.1■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 CARMIL3Q8ND23 1372 aa19.09■□□□□ 0.65
BRMS1-204ENST00000525127 SLFN5Q08AF3 891 aa19.09■□□□□ 0.65
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BRMS1-204ENST00000525127 CAMTA2O94983 1202 aa19.08■□□□□ 0.64
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BRMS1-204ENST00000525127 NRXN2Q9P2S2 1712 aa19.04■□□□□ 0.64
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BRMS1-204ENST00000525127 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP19.03■□□□□ 0.64
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BRMS1-204ENST00000525127 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.02■□□□□ 0.64
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BRMS1-204ENST00000525127 ZNF622Q969S3 477 aaKnown RBP eCLIP19.02■□□□□ 0.64
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BRMS1-204ENST00000525127 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa19.01■□□□□ 0.63
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BRMS1-204ENST00000525127 RNF181Q9P0P0 153 aa19■□□□□ 0.63
BRMS1-204ENST00000525127 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP19■□□□□ 0.63
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BRMS1-204ENST00000525127 ERBB4Q15303 1308 aa19■□□□□ 0.63
BRMS1-204ENST00000525127 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.99■□□□□ 0.63
BRMS1-204ENST00000525127 KRT24Q2M2I5 525 aa18.99■□□□□ 0.63
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BRMS1-204ENST00000525127 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP18.98■□□□□ 0.63
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BRMS1-204ENST00000525127 ZC3H4Q9UPT8 1303 aaKnown RBP18.95■□□□□ 0.62
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BRMS1-204ENST00000525127 DLEC1Q9Y238 1755 aa18.93■□□□□ 0.62
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BRMS1-204ENST00000525127 C21orf2O43822 256 aa18.93■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 CCDC30Q5VVM6 783 aa18.93■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 NPR1P16066 1061 aa18.92■□□□□ 0.62
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BRMS1-204ENST00000525127 C16orf71Q8IYS4 520 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP18.92■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP18.92■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP18.91■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 TTLL7Q6ZT98 887 aa18.91■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 LRP10Q7Z4F1 713 aa18.91■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 ZBTB3Q9H5J0 574 aa18.91■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa18.9■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 TOMM70O94826 608 aa18.9■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 NMRK2Q9NPI5 230 aa18.9■□□□□ 0.62
BRMS1-204ENST00000525127 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP18.89■□□□□ 0.61
BRMS1-204ENST00000525127 NFKBIEO00221 500 aa18.89■□□□□ 0.61
BRMS1-204ENST00000525127 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP18.89■□□□□ 0.61
BRMS1-204ENST00000525127 HYPKQ9NX55 129 aa18.89■□□□□ 0.61
BRMS1-204ENST00000525127 HSPA6P17066 643 aa18.88■□□□□ 0.61
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