RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000522519.5

MSC-AS1-208, MSC antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene MSC-AS1, Length 1,537 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MSC-AS1-208ENST00000522519 BCL2L12Q9HB09 334 aa20.17■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 CAMTA2O94983 1202 aa20.17■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 FKBP8Q14318 412 aa20.17■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 CCDC30Q5VVM6 783 aa20.17■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 NLGN1Q8N2Q7 840 aa20.17■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARXQ96QS3 562 aa20.16■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 POLD1P28340 1107 aa20.15■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 TTLL7Q6ZT98 887 aa20.15■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKRD31Q8N7Z5 1873 aa20.15■□□□□ 0.82
MSC-AS1-208ENST00000522519 HYPKQ9NX55 129 aa20.14■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa20.14■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa20.13■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 RGL2O15211 777 aa20.13■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 KIF6Q6ZMV9 814 aa20.13■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 MMP10P09238 476 aa20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 COPS6Q7L5N1 327 aa20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 XAGE3Q8WTP9 111 aa20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 STK31Q9BXU1 1019 aa20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP20.12■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 N4BP2Q86UW6 1770 aaPredicted RBP20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATP10DQ9P241 1426 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 ERVV-1B6SEH8 477 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 NEFLP07196 543 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 CLEC4GQ6UXB4 293 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZBTB3Q9H5J0 574 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF652Q9Y2D9 606 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 DLEC1Q9Y238 1755 aa20.11■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 TM4SF1P30408 202 aa20.1■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 DDR1Q08345 913 aa20.1■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 NFIXQ14938 502 aa20.1■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 HLFQ16534 295 aa20.1■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 TBC1D9BQ66K14 1250 aa20.1■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP20.08■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 PPP1R1BQ9UD71 204 aaPredicted RBP20.08■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 CACNA1SQ13698 1873 aa20.08■□□□□ 0.81
MSC-AS1-208ENST00000522519 CARMIL3Q8ND23 1372 aa20.08■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 LAMB2P55268 1798 aa20.08■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 SLC4A2P04920 1241 aa20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 CT47B1P0C2W7 299 aaPredicted RBP20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 PARP3Q9Y6F1 533 aa20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 BICDL1Q6ZP65 573 aa20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 PLBD2Q8NHP8 589 aa20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF428Q96B54 188 aa20.07■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 C10orf71Q711Q0 1435 aa20.06■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 MYH3P11055 1940 aa20.06■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 COL11A2P13942 1736 aaPredicted RBP20.06■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa20.06■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 G2E3Q7L622 706 aa20.06■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP20.05■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP20.05■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 FLIIQ13045 1269 aa20.04■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 RNF123Q5XPI4 1314 aa20.04■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 SETDB2Q96T68 719 aa20.04■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 ADCY9O60503 1353 aa20.03■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 DDX58O95786 925 aaKnown RBP20.03■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 UBN2Q6ZU65 1347 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 SERPINB2P05120 415 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 ALDH1L2Q3SY69 923 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 ZNF34Q8IZ26 560 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 SSH1Q8WYL5 1049 aa20.02■□□□□ 0.8
MSC-AS1-208ENST00000522519 GPTP24298 496 aa20.02■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 RIC3Q7Z5B4 369 aa20.02■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP20.02■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP20.01■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 TCIRG1Q13488 830 aa20.01■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 KLHL34Q8N239 644 aa20.01■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP20.01■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa20■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP20■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 KSR2Q6VAB6 950 aa20■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 BCL2L13Q9BXK5 485 aa20■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 PI4KAP2A4QPH2 592 aa19.99■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 PRR5LQ6MZQ0 368 aa19.99■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa19.99■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa19.99■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 CD2APQ9Y5K6 639 aa19.99■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 RARSP54136 660 aaKnown RBP19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 PARP10Q53GL7 1025 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 CNBD1Q8NA66 436 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 SYT17Q9BSW7 474 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 ISCA1Q9BUE6 129 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 SMC4Q9NTJ3 1288 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 PXDNLA1KZ92 1463 aa19.98■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP19.97■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 SUSD4Q5VX71 490 aa19.97■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 NLRP10Q86W26 655 aa19.97■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.97■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 FAM177BA6PVY3 158 aa19.96■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa19.96■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 NTSR2O95665 410 aa19.96■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP19.96■□□□□ 0.79
MSC-AS1-208ENST00000522519 ERICH6BQ5W0A0 696 aa19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.9 ms