RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515147.1

ITGA3-215, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 4

Gene ITGA3, Length 535 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-215ENST00000515147 KCNQ3O43525 872 aa24.17■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 CFAP53Q96M91 514 aa24.17■■□□□ 1.46
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ITGA3-215ENST00000515147 DDNO94850 711 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 SRGNP10124 158 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 CNBD1Q8NA66 436 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 TAOK3Q9H2K8 898 aa24.16■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 BTBD11A6QL63 1104 aa24.15■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 STYK1Q6J9G0 422 aa24.15■■□□□ 1.46
ITGA3-215ENST00000515147 CHADLQ6NUI6 762 aa24.15■■□□□ 1.46
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ITGA3-215ENST00000515147 MKRN1Q9UHC7 482 aaKnown RBP24.12■■□□□ 1.45
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ITGA3-215ENST00000515147 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
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ITGA3-215ENST00000515147 CLEC4GQ6UXB4 293 aa24.05■■□□□ 1.44
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ITGA3-215ENST00000515147 DLG5Q8TDM6 1919 aa24.05■■□□□ 1.44
ITGA3-215ENST00000515147 ZNF541Q9H0D2 1346 aa24.05■■□□□ 1.44
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ITGA3-215ENST00000515147 IQCA1LA6NCM1 817 aa24.03■■□□□ 1.44
ITGA3-215ENST00000515147 NBPF26B4DH59 902 aa24.03■■□□□ 1.44
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ITGA3-215ENST00000515147 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.98■■□□□ 1.43
ITGA3-215ENST00000515147 COL4A5P29400 1685 aa23.98■■□□□ 1.43
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ITGA3-215ENST00000515147 MIS18AQ9NYP9 233 aa23.97■■□□□ 1.43
ITGA3-215ENST00000515147 KDM3BQ7LBC6 1761 aa23.96■■□□□ 1.43
ITGA3-215ENST00000515147 FAM177BA6PVY3 158 aa23.96■■□□□ 1.43
ITGA3-215ENST00000515147 EAPPQ56P03 285 aaPredicted RBP23.96■■□□□ 1.43
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ITGA3-215ENST00000515147 FZD9O00144 591 aa23.95■■□□□ 1.42
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ITGA3-215ENST00000515147 SYNE4Q8N205 404 aa23.94■■□□□ 1.42
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ITGA3-215ENST00000515147 MAP1SQ66K74 1059 aaPredicted RBP23.91■■□□□ 1.42
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ITGA3-215ENST00000515147 CNTROBQ8N137 903 aa23.9■■□□□ 1.42
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ITGA3-215ENST00000515147 THSD7BQ9C0I4 1608 aa23.89■■□□□ 1.42
ITGA3-215ENST00000515147 GPC2Q8N158 579 aa23.89■■□□□ 1.41
ITGA3-215ENST00000515147 PSMD1Q99460 953 aa23.89■■□□□ 1.41
ITGA3-215ENST00000515147 TRPM7Q96QT4 1865 aa23.88■■□□□ 1.41
ITGA3-215ENST00000515147 PNMA8AQ86V59 439 aaPredicted RBP23.88■■□□□ 1.41
ITGA3-215ENST00000515147 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.88■■□□□ 1.41
ITGA3-215ENST00000515147 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
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