RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511439.5

TOPBP1-208, Transcript of DNA topoisomerase II binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene TOPBP1, Length 1,142 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1-208ENST00000511439 HOXB4P17483 251 aaPredicted RBP6.99□□□□□ -1.29
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TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.99□□□□□ -1.29
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TOPBP1-208ENST00000511439 M0R2N6 131 aa6.98□□□□□ -1.29
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TOPBP1-208ENST00000511439 USP17L4A6NCW7 530 aa6.97□□□□□ -1.29
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TOPBP1-208ENST00000511439 USP17L1Q7RTZ2 530 aa6.97□□□□□ -1.29
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TOPBP1-208ENST00000511439 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.97□□□□□ -1.29
TOPBP1-208ENST00000511439 PALM3A6NDB9 673 aaPredicted RBP6.96□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 UCN2Q96RP3 112 aa6.93□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.92□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa6.91□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 STAG2Q8N3U4 1231 aa6.91□□□□□ -1.3
TOPBP1-208ENST00000511439 TNFRSF25Q93038 417 aa6.91□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 GLMNQ92990 594 aa6.9□□□□□ -1.3
TOPBP1-208ENST00000511439 CEP63Q96MT8 703 aa6.9□□□□□ -1.3
TOPBP1-208ENST00000511439 PLVAPQ9BX97 442 aa6.9□□□□□ -1.3
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TOPBP1-208ENST00000511439 BRD7Q9NPI1 651 aa6.9□□□□□ -1.3
TOPBP1-208ENST00000511439 SPEM2Q0P670 501 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 PRRT3Q5FWE3 981 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 TRIM11Q96F44 468 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 ZNF594Q96JF6 807 aaPredicted RBP6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 CALR3Q96L12 384 aaKnown RBP6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 MDFIQ99750 246 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 EFCC1Q9HA90 598 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 PRDM6Q9NQX0 595 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 LMTK3Q96Q04 1460 aa6.89□□□□□ -1.31
TOPBP1-208ENST00000511439 RASA1P20936 1047 aa6.88□□□□□ -1.31
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