RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000510021.5

UBE2B-207, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 2

Gene UBE2B, Length 415 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-207ENST00000510021 DNAJC10Q8IXB1 793 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF277Q9NRM2 450 aaPredicted RBP21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 KIF20BQ96Q89 1820 aa21.52■■□□□ 1.04
UBE2B-207ENST00000510021 PRR5LQ6MZQ0 368 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 BICDL1Q6ZP65 573 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC24Q8N4L8 307 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 C7orf43Q8WVR3 580 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 ZIC5Q96T25 663 aa21.51■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP21.5■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC93Q567U6 631 aa21.5■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 BCORQ6W2J9 1755 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 SRGNP10124 158 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 NOGQ13253 232 aa21.48■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 CELF2O95319 508 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 CYP19A1P11511 503 aaPredicted RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 CTU1Q7Z7A3 348 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 SAGE1Q9NXZ1 904 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 HPS5Q9UPZ3 1129 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa21.47■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 NFATC2IPQ8NCF5 419 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 WASHC2AQ641Q2 1341 aa21.46■■□□□ 1.03
UBE2B-207ENST00000510021 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP21.45■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 EPS15P42566 896 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 TBC1D9BQ66K14 1250 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 MASTLQ96GX5 879 aa21.45■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 SCNN1DP51172 638 aa21.44■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 USP50Q70EL3 339 aaPredicted RBP21.44■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 IARSP41252 1262 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 MKI67P46013 3256 aaKnown RBP21.43■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 SCN7AQ01118 1682 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 SCN11AQ9UI33 1791 aa21.43■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 A0A0C4DFX4 3053 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 SZT2Q5T011 3432 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF530Q6P9A1 599 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 GJA3Q9Y6H8 435 aa21.42■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 CARD11Q9BXL7 1154 aa21.41■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 MTHFSP49914 203 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 AKAP4Q5JQC9 854 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 OLFM4Q6UX06 510 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 COL4A5P29400 1685 aa21.4■■□□□ 1.02
UBE2B-207ENST00000510021 PLEKHO1Q53GL0 409 aaPredicted RBP21.38■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 RTKN2Q8IZC4 609 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 CNBD1Q8NA66 436 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 RNF186Q9NXI6 227 aa21.38■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 AKAP11Q9UKA4 1901 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 TRPA1O75762 1119 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 SYNE4Q8N205 404 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 JDP2Q8WYK2 163 aa21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP21.37■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa21.36■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 EIF6P56537 245 aaKnown RBP21.36■■□□□ 1.01
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UBE2B-207ENST00000510021 ST5P78524 1137 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 EIF4A2Q14240 407 aaKnown RBP21.35■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 TESK2Q96S53 571 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 ZNF408Q9H9D4 720 aa21.35■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 SNED1Q8TER0 1413 aa21.35■■□□□ 1.01
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UBE2B-207ENST00000510021 A0A087WZG4 1122 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 HUNKP57058 714 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 PKN2Q16513 984 aaKnown RBP21.33■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 AMOTQ4VCS5 1084 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 SLC17A8Q8NDX2 589 aa21.33■■□□□ 1.01
UBE2B-207ENST00000510021 NPR1P16066 1061 aa21.32■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 KIF23Q02241 960 aaPredicted RBP21.32■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 NPHP1O15259 732 aa21.31■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 C1orf141Q5JVX7 400 aa21.31■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 PSMD1Q99460 953 aa21.31■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 ADARB2Q9NS39 739 aaKnown RBP21.31■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 SETDB2Q96T68 719 aa21.3■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 PGAP2Q9UHJ9 254 aa21.3■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 KLRG2A4D1S0 409 aaPredicted RBP21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 SLC39A6Q13433 755 aa21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 RGMBQ6NW40 437 aa21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 GPRC5DQ9NZD1 345 aa21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 POLKQ9UBT6 870 aa21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 CEP290O15078 2479 aa21.28■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 VSIG10Q8N0Z9 540 aa21.27■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa21.27■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 COLQQ9Y215 455 aaPredicted RBP21.27■■□□□ 1
UBE2B-207ENST00000510021 SLC52A2Q9HAB3 445 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 MRC1P22897 1456 aa21.26■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 CCDC102AQ96A19 550 aa21.25■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 UBR2Q8IWV8 1755 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 CDC37L1Q7L3B6 337 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 CSRNP1Q96S65 589 aa21.24■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP21.23■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 SIN3AQ96ST3 1273 aa21.23■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 COL6A3P12111 3177 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 FBXO46Q6PJ61 603 aaPredicted RBP21.22■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 HDAC9Q9UKV0 1011 aa21.22■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 CAMTA2O94983 1202 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 LARGE2Q8N3Y3 721 aa21.21■□□□□ 0.99
UBE2B-207ENST00000510021 STARD3NLO95772 234 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2B-207ENST00000510021 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP21.2■□□□□ 0.98
UBE2B-207ENST00000510021 CARD14Q9BXL6 1004 aa21.2■□□□□ 0.98
UBE2B-207ENST00000510021 HTTP42858 3142 aa21.2■□□□□ 0.98
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