RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000509677.5

SH3BP2-214, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 3

Gene SH3BP2, Length 1,087 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-214ENST00000509677 GOLGA2Q08379 1002 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 MYH16Q9H6N6 1097 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 CHPF2Q9P2E5 772 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 PARP3Q9Y6F1 533 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 KIAA1551Q9HCM1 1747 aa23.55■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 BICDL1Q6ZP65 573 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 TTLL7Q6ZT98 887 aa23.54■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 ATP10DQ9P241 1426 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 TM4SF1P30408 202 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 DDR1Q08345 913 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 NFIXQ14938 502 aa23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 DDX21Q9NR30 783 aaKnown RBP eCLIP23.53■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 KIF6Q6ZMV9 814 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 LRP10Q7Z4F1 713 aa23.52■■□□□ 1.36
SH3BP2-214ENST00000509677 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 TWISTNBQ3B726 338 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 TBC1D9BQ66K14 1250 aa23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 DBF4Q9UBU7 674 aaPredicted RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 BRCA1P38398 1863 aaKnown RBP23.51■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF526Q8TF50 670 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF652Q9Y2D9 606 aa23.5■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 POLRMTO00411 1230 aaKnown RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 HLFQ16534 295 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 CCDC30Q5VVM6 783 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 COPS6Q7L5N1 327 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 XAGE3Q8WTP9 111 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBTB3Q9H5J0 574 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa23.49■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 E9PSI1 815 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 CLEC4GQ6UXB4 293 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 CHMP4AQ9BY43 222 aa23.48■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 ERVV-1B6SEH8 477 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 SETDB2Q96T68 719 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 HYPKQ9NX55 129 aa23.47■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 SERPINB2P05120 415 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 SCN7AQ01118 1682 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 SLFN5Q08AF3 891 aa23.46■■□□□ 1.35
SH3BP2-214ENST00000509677 RGL2O15211 777 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 VAMP4O75379 141 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 STK31Q9BXU1 1019 aa23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 NIP7Q9Y221 180 aaKnown RBP eCLIP23.44■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 ADCY9O60503 1353 aa23.43■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 CARMIL3Q8ND23 1372 aa23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 PHAXQ9H814 394 aaKnown RBP23.42■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 ARFGEF1Q9Y6D6 1849 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 FAM177BA6PVY3 158 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 GPTP24298 496 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 BCORQ6W2J9 1755 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 C10orf71Q711Q0 1435 aa23.41■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 NPHP1O15259 732 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa23.4■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 PXDNLA1KZ92 1463 aa23.39■■□□□ 1.34
SH3BP2-214ENST00000509677 SLC4A2P04920 1241 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP23.39■■□□□ 1.33
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SH3BP2-214ENST00000509677 PLBD2Q8NHP8 589 aa23.39■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 PRR5LQ6MZQ0 368 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 CNBD1Q8NA66 436 aa23.38■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa23.37■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP23.37■■□□□ 1.33
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SH3BP2-214ENST00000509677 G2E3Q7L622 706 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 RIC3Q7Z5B4 369 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF34Q8IZ26 560 aa23.36■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 UBN2Q6ZU65 1347 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 A0A0G2JLW4 131 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 TCIRG1Q13488 830 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 TPTE2Q6XPS3 522 aa23.35■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 DDX58O95786 925 aaKnown RBP23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 DPEP1P16444 411 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 ST5P78524 1137 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 BCS1LQ9Y276 419 aa23.34■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.33
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SH3BP2-214ENST00000509677 NYXQ9GZU5 481 aa23.33■■□□□ 1.33
SH3BP2-214ENST00000509677 HSPA6P17066 643 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 CHRNA5P30532 468 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 PARP10Q53GL7 1025 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 BRIP1Q9BX63 1249 aa23.32■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 FLIIQ13045 1269 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 NUTM1Q86Y26 1132 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 ZNF428Q96B54 188 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 ZBED9Q6R2W3 1325 aa23.31■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 NRXN2Q9P2S2 1712 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 PI4KAP2A4QPH2 592 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 KSR2Q6VAB6 950 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 NLRP10Q86W26 655 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 PI4KAP1Q8N8J0 262 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 NUP98P52948 1817 aa23.3■■□□□ 1.32
SH3BP2-214ENST00000509677 SBF1O95248 1867 aa23.3■■□□□ 1.32
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