RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000505552.1

ITGA3-205, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

TSL 2

Gene ITGA3, Length 600 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-205ENST00000505552 KAZALD1Q96I82 304 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 CCDC136Q96JN2 1154 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ANKRD36CQ5JPF3 1778 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 BCORQ6W2J9 1755 aa7.17□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 EP400Q96L91 3159 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 NUP98P52948 1817 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 A0A0G2JS52 829 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 EIF5P55010 431 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 SIK1P57059 783 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 MYT1Q01538 1121 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 AMIGO3Q86WK7 504 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 SMC5Q8IY18 1101 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 METTL22Q9BUU2 404 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 CHMP4BQ9H444 224 aaKnown RBP7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 C1orf115Q9H7X2 142 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 MAP3K2Q9Y2U5 619 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 KAT6BQ8WYB5 2073 aa7.16□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 AFDNP55196 1824 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 NEURL1BA8MQ27 555 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ALDH1L1O75891 902 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 MYL6BP14649 208 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 CEP85Q6P2H3 762 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 PROM2Q8N271 834 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ANKRD44Q8N8A2 993 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 LINC00116Q8NCU8 138 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 PLBD2Q8NHP8 589 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 ISCA1Q9BUE6 129 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 TEX13AQ9BXU3 409 aaPredicted RBP7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 COL15A1P39059 1388 aa7.15□□□□□ -1.26
ITGA3-205ENST00000505552 C4BP0C0L5 1744 aa7.15□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 C4AP0C0L4 1744 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 CRKLP46109 303 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 KCNQ4P56696 695 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SCN7AQ01118 1682 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 POLA2Q14181 598 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 UBR3Q6ZT12 1888 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 KRT27Q7Z3Y8 459 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 LINS1Q8NG48 757 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SMARCC1Q92922 1105 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 CNTNAP4Q9C0A0 1308 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 LRRC4BQ9NT99 713 aa7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 ATF5Q9Y2D1 282 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 PNMA6EA0A0J9YXQ4 647 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 MYCNP04198 464 aaPredicted RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 PDE4AP27815 886 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 ATP6V1AP38606 617 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 MTX1Q13505 466 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 GCKRQ14397 625 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 HLFQ16534 295 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 EPHA10Q5JZY3 1008 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SLC4A10Q6U841 1118 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 DCTPP1Q9H773 170 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 FOXD4L1Q9NU39 408 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 COL24A1Q17RW2 1714 aa7.13□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 H7C1W4 665 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 CAMTA2O94983 1202 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 STARD3NLO95772 234 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 ATP8B2P98198 1209 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RC3H1Q5TC82 1133 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 FAM196AQ6ZSG2 479 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SMIM5Q71RC9 77 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RPAP2Q8IXW5 612 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SSH3Q8TE77 659 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SUCLG2Q96I99 432 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 MYD88Q99836 296 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 BCL2L12Q9HB09 334 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 TUBGCP6Q96RT7 1819 aa7.12□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 UBN2Q6ZU65 1347 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 SALL3Q9BXA9 1300 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 DDX60Q8IY21 1712 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 ERVV-1B6SEH8 477 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 ATP5J2-PTCD1G3V325 749 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 GRM8O00222 908 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 GNAI2P04899 355 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 GNAI3P08754 354 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RXRBP28702 533 aa7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 RFX5P48382 616 aaPredicted RBP7.11□□□□□ -1.27
ITGA3-205ENST00000505552 NUCB1Q02818 461 aa7.11□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 14.3 ms